安利一款人类蛋白互作网络分析神器

蛋白质-蛋白质相互作用（PPIs）对许多细胞过程是重要的，蛋白质-蛋白质相互作用的系统图谱已经成为功能基因组学的核心任务，最真实反映蛋白质参与生命进程、发挥生物学功能的数据表现形式。通过网站生成的相互作用数据集是生物学和医学科研工作者的宝贵资源。

然而不同交互网络之间缺乏重叠性，完整性和整合性。如果科研人员寻找关于特定人类蛋白质的潜在相互作用蛋白的全面信息，则需要询问众多数据库。

‍今天为大家介绍的网站是一款整合多个人类蛋白质相互作用的数据库，它被称为UniHI---Unified Human Interactome，网站网址：http://www.unihi.org/。

目前，UniHI提供了一个搜索平台，可以结合并访问十个不同的大型人类PPI数据集。它包括超过17万种蛋白质之间的超过15万个相互作用。UniHI为研究人员提供了一个灵活的综合工具，用于查找和使用关于人类蛋白相互作用的全面信息。

UniHI数据库的结构设计用于整合从不同来源获得的PPI数据，采用MySQL数据库管理系统作为关系数据库实施。它由六个关键表格组成：蛋白质，蛋白质分析，蛋白质分布，相互作用分布，相互作用性质和相互作用分数。它将蛋白质与它们的性质，它们的相互作用和分布以及不同的PPI数据集相关联。

下面介绍一下网站的基本功能：

1.基于Java编程语言的搜索界面提供了两种不同的搜索选项：在单个蛋白质搜索中，用户输入单个蛋白质来查询其直接交互蛋白。在面向网络的多蛋白质搜索中，用户可以提供一系列蛋白质。目前可以支持多种基因符号：Entrez基因ID，Uniprot ID，Unigene ID，OMIM ID，NCBI Geneinfo ID或Ensembl ID来输入蛋白质。

‍2.点击Submit按钮进行搜索后，网站第一栏显示四部分信息。

(1)点击[Protein]按钮，网页展示了基因的一般信息，基因别名，ID号码以及参与的生物学通路。

(2)点击[Physical Interactions]按钮进行搜索后，网页以文本形式展示基因间相互作用蛋白质，包含了互作蛋白名称，详细信息以及来源的多个数据库，同时提供超链接。为了便于区分，不同数据库使用不同颜色进行具体区分：蓝色阴影用于通过文献检索获得的数据集，绿色阴影用于来自于同源基因获得的数据集。

(3)‍点击[Regulatory Interactions]按钮,可以检索调控蛋白的基因或者microRNA，以及对应的数据库等。

(4)点击[Network]按钮即可以查看蛋白质-蛋白质相互作用网络图。被查询的蛋白质由灰色的矩形表示，它们相互作用的蛋白以黄色矩形表示，点击任意一个矩形可以查看蛋白的基本信息。蛋白之间的线条表示蛋白之间存在互作关系。

同时，网站还设置检索限定选项，可以通过右侧工具栏进行设置，包含互作信息来源数据库、验证方法、试验规模、互作类型等等。也可以进行特定组织蛋白的筛选、药物靶点、基因富集信号通路分析等多方面的应用。

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