你要的R语言处理GEO芯片数据的视频出炉啦！

还记得你的投票吗？

首发于生信菜鸟团博客：http://www.bio-info-trainee.com/2087.html

腾讯视频地址：https://ke.qq.com/course/286407 （点击文末的阅读原文可以购买）

早期目录如下：

第一讲：GEO，表达芯片与R 第二讲：从GEO下载数据得到表达量矩阵 第三讲：对表达量矩阵用GSEA软件做分析 第四讲：根据分组信息做差异分析 第五讲：对差异基因结果做GO/KEGG超几何分布检验富集分析第六讲：指定基因分组boxplot指定基因list画热图 第七讲：根据差异基因list获取string数据库的PPI网络数据第八讲：PPI网络数据用R或者cytoscape画网络图第九讲：网络图的子网络获取 第十讲：hug genes如何找

之前的视频假设大家有R语言基础，并不适合初学者。

现重新委托南京医科大学张驰博士录制基础视频，大家可以以此来入门R语言，及表达芯片数据处理。有需要的朋友可以添加讲师的微信进入学员交流群，记住，非必须，因为本来这个课程就是近乎赠送价格，所以不提供群聊答疑服务，而且这个群聊也不一定是仅仅聊GEO数据库表达芯片，遵从生信技能树的惯例，考虑到讲师拉群聊的辛苦，请务必加好友后发送18.8元红包。

并且我也给出了更新版教程

更新版目录：

差异分析得到的结果注释一文就够这里，就不放我的二维码了，不过，欢迎大家来我们生信技能树知识星球提问！（免费）

R语言

很早之前我就在公众号发布过linux总结，可以先浏览，有个大概印象，等学完了再回过来看看：

生信分析人员如何系统入门R？

下面是我给初学者总结的索引：

初阶资料

知道什么是R语言，了解基本语法，Rstudio编辑器，读写文件，跟Excel的区别，绘图等可视化，生物信息学相关的bioconductor系列包。

首先下载R语言打印版的 cheatsheet，链接: 密码:4tsn 放在办公桌，或者枕头边上，随时浏览记忆。然后这里有一个网络视频教程，链接: 密码:ga9x 是数据分析与R语言视频教程+课件 请务必抽时间听完，一步步跟着操作学习，可以保证你R语言能入门。

上面的链接可能会被百度云封锁(现在知识产权保护越来越严格了)，看看这个：链接:https://pan.baidu.com/s/1bptknXt 密码:7tmg 生信入门(包括史上最全R语言资料合集，北大的生物信息学公开课等) 浏览器打开，选择感兴趣有需要的资料下载即可

如果所有的链接都失效了，你试试看百度云搜索功能，也许可以找到我们新的分享。

尤为注意的是，初学者千万不要钻牛角尖，而是要广泛涉猎，牢记基础，应用加实践，其背后的计算机逻辑算法等可以后期再补，而且要时刻记住，学习R语言是为了分析生物信息学数据。

约翰·霍普金斯大学的Bioconductor学习课程
斯坦福大学的暑期小课程-用bioconductor做统计分析
a Little Book of R for Bioinformatics!
生物学家应该这样学R绘图-视频，数据，代码全公开

一般不建议初学者直接下载 史上最全R语言资料汇总链接:https://pan.baidu.com/s/1bptknXt 密码:7tmg 里面的资料实在是太多了，初学者很容易迷失在里面。但我还是给大家，毕竟入门之后的提高，还是用得着的。

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