六味地黄丸和金匮肾气丸的区别是很明显的，都是治疗肾虚，但是六味地黄丸是治疗肾阴虚，金匮肾气丸是治疗肾阳虚。具体来说六味地黄丸的主要治疗肾阴亏所引起的头晕、耳鸣、腰膝酸软、盗汗、遗精、消渴，甚至治疗牙齿的松动、足跟疼、小便淋漓不尽。金匮肾气丸主要治疗肾阳虚，多见于怕冷、怕风、痰多湿重、身体虚弱、阳痿、早泄、水肿、腰膝酸软，特别像女性可以出现腿肿肥胖、晚上尿比较多、男性也表现为夜尿频多，这些都是金匮肾气丸的主证。