防卫大臣负责日本全国的国防事务，不需要经过内阁，即可自行向国会两院提出与国防相关的法案及预算案。防卫大臣通过统合幕僚长（とうごうばくりょうちょう）及陆上自卫队幕僚长（りくじょうばくりょうちょう）、海上自卫队幕僚长（かいじょうばくりょうちょう）、航空自卫队幕僚长（こうくうばくりょうちょう）对日本自卫队（じえいたい）的部队、机关进行指挥监督，防卫大臣有权调动日本情报本部（じょうほうほんぶ）的任何一支分队。