一个国际团队系统地研究了来自38个不同类型癌症患者的2,600多个肿瘤样本中的DNA，他们在13％的研究样本中发现了病毒痕迹，并进一步确定了病毒用于触发致癌性的一些机制突变。图片来源：整个基因组的泛癌分析
东英吉利大学的研究人员帮助开展了对各种癌症中发现的病毒的首次全面调查。
一个国际团队系统地研究了来自38种不同类型癌症患者的2,600多个肿瘤样本中的DNA 。
他们在所研究的13％的样本中发现了病毒的痕迹，并进一步确定了病毒用于触发致癌突变的一些机制。
这项发现是在UEA科学家开创了一种发现与癌症有关的细菌和病毒的新方法之后的。
来自UEA诺里奇医学院的丹尼尔·布鲁尔博士和厄尔勒姆研究所（EI）的来访工人说：“我们已经知道感染和癌症之间存在着很强的联系。例如，消化道中存在幽门螺杆菌可以导致胃溃疡，并与胃癌有关。
“与此同时，某些类型的HPV 病毒可引起宫颈癌。
随着人类进入基因组医学时代，人体组织越来越多地被全基因组测序。
“当对肿瘤样本进行全基因组测序时，还会对来自任何病原体的DNA进行测序，从而可以检测和定量病毒。
“这为我们提供了绝佳的机会来收集数据，以发现病毒与不同类型癌症之间的新关联。
“这是首次对大多数病毒的癌症类型进行系统的研究。
“重要的是，在感染和癌症类型之间找到新的联系有可能提供疫苗，例如HPV疫苗，这可以减少癌症对全球的影响。”
迄今为止，已经鉴定出11种病原体是致癌的，包括幽门螺杆菌，某些类型的HPV病毒，乙型肝炎，丙型肝炎和爱泼斯坦-巴尔病毒。
全世界每年仅人类乳头瘤病毒（HPV）引起的癌症就有64万种，而疫苗有望预防绝大多数宫颈癌。
这项新研究概述了哪些病毒在哪些癌症中起作用。
研究人员还寻找了以前与致癌作用甚至完全未知的病毒。
DKFZ的Marc Zapatka博士说：“与病毒相关的病毒问题在医学上高度相关，因为在病毒相关的癌症中，真正的预防是可能的。
“如果鉴定出致癌病毒，就有可能避免用疫苗感染以预防癌症的发展。”
该研究由德国癌症研究中心（DKFZ）领导，是全基因组泛癌分析（PCAWG）的一部分，该联盟由1300多名研究人员组成，旨在确定哪些基因突变或DNA突变模式在几种类型的肿瘤中起作用。这是国际癌症基因组联盟（ICGC）发起的一项倡议。
为了进行这项荟萃分析，他们对来自38种不同类型癌症的2600多个肿瘤基因组的测序数据进行了全面的生物信息学分析。
该团队在356名癌症患者中发现了23种不同病毒类型的痕迹。正如预期的那样，已知的肿瘤引发和生长的病毒驱动器是最常见的。
在所调查的癌症基因组中，发现有EB病毒（EBV）的基因组，已知其会引起多种不同类型的癌症（尤其是淋巴瘤，胃癌和鼻咽癌）。在330例肝癌中有62例发现了乙肝病毒（HBV）DNA。
研究小组在20例宫颈癌病例中的19例和57例头颈部肿瘤中的18例中发现了人类乳头瘤病毒，最常见的是HPV16。
布鲁尔博士说：“我们发现，HPV的存在与头颈部癌的一些重要变化是相互排斥的，这意味着HPV病毒可以帮助癌症发展，而其基因组没有其他变化。”
研究小组还排除了某些病毒（包括腺病毒和杆状病毒）与癌症之间的联系。
在少数情况下，研究小组发现了其他已知会引起癌症的病毒，例如肾癌中的逆转录病毒。有时在正常感染的组织类型的肿瘤中发现其他病原体，例如胃癌中的巨细胞病毒。
在与HPV和EBV相关的一些肿瘤中，研究人员观察到，这些癌症类型的细胞正常生长所依赖的特征性驱动基因突变缺失了。病毒的存在可能通过其他因素支持恶性细胞变性。
发现病毒整合入宿主基因组是导致由病毒特别是HVB和乳头瘤病毒引起的突变的最重要机制。
布鲁尔博士说：“我们还发现，肿瘤中病毒的存在与基因组变化的模式有关，这种变化与人类细胞中DNA损伤修复机制的缺陷有关。这表明抗病毒药物的作用减弱防御是宫颈癌，膀胱癌和头颈癌的驱动力。”
来自德国癌症研究中心（DKFZ）的彼得·利希特（Peter Lichter）教授说：“在分析整个癌症基因组时，与仅基于RNA的早期研究相比，我们发现了更多的肿瘤中存在病毒痕迹。但是，我们无法证实人们普遍认为其他未知病毒与癌症有关。
“但是，在许多情况下，我们现在对病原体如何引起细胞恶性突变有了更清晰的认识。”
该研究由英国鲍勃·冠军癌症基金会，英国癌症研究基金会，达拉格里奥基金会，共济会慈善基金会，国王家族和哈格雷夫基金会资助。
鲍勃冠军癌症基金会（Bob Champion Cancer Trust）的戴维·迪纳里（David Dearnaley）教授说：“这是一个强大的国际合作企业，对人类癌症的病毒协会进行了分类。
“ 使用可靠的方法避免“虚假发现”，对超过2600种癌症和配对的正常组织进行了深入的全基因组测序，结果表明约16％的癌症与病毒有关，高于先前的估计。
“已经证实了多种病毒与子宫颈癌，头颈癌，肝癌和胃癌的已知关联，但推定与脑肿瘤的关联被驳回。
“研究人员已经探索了相关机理的机械解释，显示出例如病毒整合可能驱动端粒酶高表达，这是致瘤性的，并强调了病毒整合对免疫反应的潜在重要性。
“新型病毒分离物'击中'并不常见。结果为肿瘤分类提供了重要的新见识，并为开发新型癌症靶向策略带来了未来的希望。”
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