阿米巴组织划分是中国企业导入阿米巴经营，并且成功落地实施关键。阿米巴组织划分可按产品、客户、区域、品牌、价值链来进行，把企业从整体上划分为许多个能够进行独立核算的阿米巴组织。并且，不同行业的阿米巴组织划分，要因“业”制宜。
以下为三个不同行业划分阿米巴组织的案例：
某品牌手机营销部门进行阿米巴组织划分
某手机营销部主要负责品牌手机的销售工作，他们要制定手机营销计划并实现这个计划以把手机销售出去。因此，根据阿米巴组织划分原则，从工作职能的角度划分为策划部、销售部、客户部、推广部、合约部。
策划部主要负责制定品牌手机定位推广方案，主要有文案及图案两方面，于是又可以把策划部分成文案小组与平面小组两个阿米巴;
而销售部主要根据策划部制定的手机品牌推广方案进行销售，1个项目通常由3～4个小组负责，但是每个项目的销售人员最好不要超过12个，
这样可以精简人员，发挥每个人的销售潜能。分工明确能够激发让员工各司其职，发挥专长，从而把手机销售出去。
其他客户部、推广部、合约部均可实现独立完成一道工序且有市场价值衡量，因此可以根据公司实际情况各自划分为独立的阿米巴，自负盈亏，从而实现“人人成为经营者”这一目的。
服装生产部门进行阿米巴组织划分
服装生产部门主要根据工序的不同进行组织划分，服装生产的基本工序流程包括：排料→裁剪→缝制→锁眼钉扣→整烫这五道工序。
根据阿米巴经营理念中的组织划分原则，这五道工序都可以独立完成一道工序并且能够创造市场价值，因此，我们可以将它们划分成为五个阿米巴，每个阿米巴都有一个管理者，这个管理者根据每天制定的“单位时间核算表”来核算部门内部的盈亏情况，当市场发生变化时，这个管理者可以及时做出应对措施。
服装生产部门经过组织划分后可以更加明确每道工序的职责，而且不同工序之间进行买卖以取得销售收入，也更加能够提高员工的工作积极性与参与度，从而为企业培养优秀的管理人才，可谓一举多得。
机动车制造车间进行阿米巴组织划分
在机动车制造业中，有四大核心技术: 冲压工艺、焊装工艺、涂装工艺、总装工艺,每道工序又可以细分,比如冲压工序可以分成冲裁、弯曲、拉深、局部成形四个基本工序;涂装工序有漆前预处理和底漆、喷漆、烘干三个工序。
机动车制造车间如何进行阿米巴经营组织划分?从工序入手，首先把制造车间分成四个阿米巴：冲压阿米巴、焊装阿米巴、涂装阿米巴、总装阿米巴，然后由于冲压部门有四道工序组成且每道工序皆可独立核算。
此外，可以把冲压阿米巴划分成为冲裁、歪曲、拉深、局部成形四个小组，以此类推，把制造车间划分成一个个阿米巴组织，明确各自职能，提高员工工作积极性与主人翁意识，自觉为企业创造财富。
无论怎样进行阿米巴组织划分，都本着这样的原则：使组织资源与外部环境的联系更加紧密，并具有迅速调节功能以适应灵活多变的市场环境的能力。
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