质谱仪是测量带电粒子质荷比（简称m/Q、m/q、m/Z或m/z）的一种装置，包括四个基本组成部分：
1. 进样系统：将固体或液体样品转变为气态的样品入口装置；
2. 离子源：将样品分子电离成带电的离子；
3. 质谱分析器：根据质荷比m/Q的不同，将样品离子分离；
4. 离子检测器：用于检测和量化离子流强度。
图1：串联质谱仪的主要组成部分。A：样品在离子源中发生电离，进入第一质量过滤器（Q1），然后进入碰撞池（Q2），接着进入第二质量过滤器（Q3），最后进入检测器。B和C描述了目前临床LC-MS/MS仪器中使用的两种主要的电离源：电喷雾电离（ESI，B）和常压化学电离（APCI，C）。在ESI中，从LC流出的溶剂分析物通过带正电荷的毛细管进入离子源，并被雾化成带正电荷的溶剂分析物液滴，这些液滴飞向带负电的面板，溶剂在途中蒸发，直到它们在库仑爆炸中解体，这时电离成分的排斥电荷超过了它们的表面张力，然后，单个电离分析物分子通过面板入口孔进入质谱仪。在APCI中，来自LC的溶剂分析物被加热的喷雾气体蒸发，溶剂蒸汽的极性成分被电晕针的大电流放电电离，溶剂分子随后将其电荷转移到可电离的分析物分子上，分析物分子通过面板入口孔进入质谱仪。
除了这些基本组件外，每台质谱仪还需要两个必要的辅助组件：
1. 以适当形式将样品输送至入口/汽化器的装置：通常是某种形式的色谱装置，或基质辅助激光解吸（MALDI）的固体靶和处理固体样品的相关技术
2. 探测器信号的信号处理/数据还原装置：通常是某种形式的模拟数字转换器（通常是质谱仪的一部分），以及用于数据还原、显示、分析和量化探测事件的固件和计算机软件的组合。
在临床实践中，几乎所有的质谱仪都是单或串联质谱滤光片（四极杆）设计，前端连着的是气相色谱或液相色谱。
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Agilent-6495B三重四极杆LC-MS
Q Exactive TM 质谱联用仪
Micromass Quattro Micro API -LC/MS/MS
AB Triple TOF® 5600+ LC/MS/MS系统
岛津超高效液相色谱仪（LC-30AT）连接SCIEX 5600+ 质谱仪
Agilent 7890A/5975C -GC/MS
参考文献：Grebe S K , Singh R J . LC-MS/MS in the Clinical Laboratory – Where to From Here?. Clin Biochem Rev. 2011.
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