Nature Methods：中国科学家开发分离RNA结合蛋白的新技术

RNA 结合蛋白（RBPs）与RNA分子相互作用，对RNA的合成、选择性剪接、修饰、转运和翻译等生命活动的调控具有重要作用。因此，研究RBPs的分离技术对研究RNA与蛋白的互作具有重要意义。前期，科学家们系统地分离了细胞内mRNA结合蛋白，但这只是众多转录本中的一部分，细胞还包含了很多非polyA RNA。近日，中国科学院广州生物医药与健康研究院研究员Miguel Esteban、张必良和副研究员鲍习琛领衔的科研团队在Nature Methods杂志在线发表了题为“Capturing the interactome of newly transcribed RNA”的论文，报道了一种新的RNA结合蛋白分离技术——RICK技术，该技术是全面分析细胞内的RNA－蛋白相互作用的重要工具，有助于揭开基因组中非编码RNA的未知功能。

该研究开发的新技术被称为RICK（Newly Transcribed RNA interactome using click chemistry）技术。该技术利用核酸标记技术，巧妙地将新合成的RNA标记上生物素，通过链霉亲和素偶联的磁珠，分离得到相应被标记RNA分子和与其相结合的蛋白分子。 通过这一技术，研究人员系统地分离了包括非polyA尾RNA和新生RNA在内的一系列RNA分子及其结合蛋白。进一步地分析发现，细胞分裂调控因子作为新的RNA结合蛋白，存在结合非polyA尾RNA的潜能。研究人员缩短标记的时间，成功地在细胞中分离了新生RNA结合蛋白。这些蛋白与新生RNA的转录及后续的加工、剪切等调控密切相关。这一技术的应用将有助于深入地剖析RNA结合蛋白的作用机制，也是细胞命运转变过程中分析RNA蛋白相互作用的重要工具。

RICK技术原理图