科学是干什么用的？它是用来发现自然规律，并用来指导人的，因此，关于人的科学就是科学中的科学，中医作为一门研究人的学问，当然是科学的最前沿。
西方科学发展到现在，对人体了解多少？虽然我们基本上搞清楚了人体的结构，从功能系统到器官、从组织到细胞，再从基因到原子，但它却告诉我们不了人为什么活着？更不能告诉我们如何来活？更可笑的是，连最基本的生命是什么都不知道。不信的话可以一试，看看西方科学能否用这些构件组成一个生物系统。
西方科学的问题在哪呢？如果你迷信精密仪器，认为从精密仪器看到的就是真的，就会想当然地认为西医是科学。但是，如果你相信万物归一，马上你的观点就会发生天翻地覆的变化。因为如果万物归一，那么组成精密仪器的物质和所有被观测的物质本质上就是一样的，用它只能观测由统一物质组织起来并出现个性的东西，而对共性的统一物质的混沌状态就是永远不可观察的。也就是说，精密仪器忽视了隐藏在现象背后的混沌世界。
现在的问题是，我们如何来认识这些精密仪器观察不到的物质运动呢？对西方科学来说这是无能为力的，而对古中国人来说，这个问题是简单的，这个方法就是取象类比，或者说通过系统间的类比。理由很简单，既然万物归一，那么必然有万物一理，既然万物一理，我们就可以根据万物在运动原理上的统一性，通过系统间的类比来认识万物。有了这种方法论，我们就可以从宏观系统来认识微观系统，从可观察的系统现象来认识不可观察的系统现象，从而得到对自然更本质的认识。
显然，中国先人认识万物的方法论就是系统方法，其实也就是人们常说的哲学方法。许多人不了解哲学，其实哲学并不是空洞的想象，而是有一个坚实的物质基础，它就是物质的统一性，有了这种统一性，我们就能够轻松地认识到，万物归一气，万物同一理，一通百通。用西方哲学家的话来说，你认识了自己，也就认识了自然，因为人存在与发展的原理就是万物存在与发展的原理，哲学就是根据人和万物在运动原理上的统一性，通过认识自己存在与发展的原理来领悟自然最普遍规律的学问。
科学之所以能够称之为科学，就是因为自然呈系统的秩序，科学的目的就是发现支配自然秩序的规则，用来指导人的生存。可西方科学的发展从一开始就站在一个错误的前提假设之上，它不仅否定了万物在空间中的连续性，使生命问题不可认识，而且否定了物质彻底的统一性，使普遍联系问题不可认识，直到现在，西方科学也无法解释最简单的系统现象。
当然，西方科学中也发展出了系统理论，但是，这个系统理论也是站在过去还原论基础上的，因此，无论科学家们付出再大的努力，终究是一场空。要实现系统科学的突破，方法只有一个，那就是在中国气一元论的基础上对西方的系统科学进行重建，有了物质在空间中的连续性，生命问题就解决了，有了物质彻底的统一性，普遍联系问题就解决了。这样一来，一个完整的系统科学体系就建立了，用它可以解释自然界的一切系统现象，中医的科学性证明也不在话下。
为什么西方科学解释不了中医？答案是显而易见的，那就是迷信精密仪器，不承认观察不到的物质存在，结果把人与自然的关系，以及整体与局部的关系忽视了。中医是通过系统间类比的方法认识到这些关系的，即人体系统与地球系统。我们知道，随着自然的周期变化，万物皆有潮汐效应，但唯有水的潮汐效应最强，这就说明，水可以强烈吸收大自然能量，同时也说明大自然变化也主要是通过作用于人体的水来影响人体的。虽然这种影响精密仪器观察不到，但它是客观存在的，它直接影响着我们每一个人的生死存亡。同理，地球这个物质系统的能量循环主要靠水，由此类比到人体，也可以得出人体普遍联系的物质基础就是连续在全身的水，中医学的经络学说就是对这种普遍联系方式的一种高度概括。
西医的问题在哪？一是忽视了人与自然的关系，二是忽视了整体与局部的关系，最终把疾病的原因单调地归于局部的细胞病变之上。其实，细胞病变并不是病因，而是疾病的结果，把结果当成是病因，就造成了西医在治病方法论上的错误。
中医是建立在系统科学之上的，通过系统间的类比，它不仅认识到了人与自然的关系，得出了人是自然无限小的一部分，顺应自然则生，违背自然则死，疾病就是大自然对不顺应它的人的一种惩罚；而且还认识到了整体与局部细胞的关系，得出了细胞是整体无限小的一部分，它们之所以病变，并不是细胞的原因，则是不平衡引起的整体管理失控造成的。而中医就是一门恢复整体管理的学问。
很多著名的哲学家都说过，你只要认识了自己，也就认识了世界。因为人和万物一样，不仅由同一种物质组成，也由同一个原理支配，如果认识了自己，也就一通百通，这是科学发展的最高境界，也是西方科学发展的方向，中医就是帮助人类认识自己的一门科学。
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