沙皇尼古拉二世登基之时，沙俄正处于政治风起云涌的变革时期。19世纪末，沙俄的国内贫富差距进一步扩大，大量农民破产，社会矛盾激化。面对这些情况，他从维护统治的角度出发，继续对内改革，对外扩张。1900年，俄国参加八国联军侵华战争，并乘机出兵占据中国东北，控制了旅顺、大连，获得沙俄盼望得到的理想出海港口，并建设军事基地，以备扩张。
1904—1905年，日俄战争在中国东北爆发。最终，在这场战争中沙俄的海军及陆军均遭致惨败。1907年，英国与沙俄协定签订，在欧洲形成了英、法、俄的协约集团，同德国、奥匈的同盟国集团对峙的格局。1914年，第一次世界大战爆发后。沙俄积极地参与战争，他企图从奥斯曼土耳其手里夺取黑海海峡、君士坦丁堡和亚美尼亚，还想从奥匈帝国手里夺取加里西亚。
1917年3月，首都圣彼得堡市民发动反饥饿游行，爆发了资产阶级领导的二月革命，结束了罗曼诺夫王朝的专制统治。接着，布尔什维克又在当年发起十月革命，建立红色苏维埃政权。尼古拉二世就此成为末代沙皇。
二月革命后成立的克伦斯基政府，还算善待尼古拉二世，他们便宜被安置在位于托博尔斯克的政府官邸。沙皇只是失去了统治权，仍有众多仆役相伴，日常起居与在宫廷相比差别不大，还算是很舒适。
红色政权对沙皇就不会那么仁慈了，他们全家被逮捕，遭到囚禁，沙皇也禁止再佩戴象征荣誉和权力的帝皇肩章。1917年底的冬天，沙皇全家第一次品尝到了俄罗斯的寒冬是什么滋味。1918年，他们被囚禁于叶卡捷琳堡伊帕切夫别墅，在这段日子里，生活待遇很差，他们希望每天能有黄油吃，喝一次咖啡的愿望，被负责看管他们的人认为，这是“过于腐化奢侈”的生活而拒绝。
1918年7月16日深夜，也可能是在7月17日凌晨。沙皇夫妻和一子四女共7人，还有4名仆人，分别是沙皇的御医、厨师、男仆、贴身女仆。四位公主分别是23岁的奥丽加、21岁的塔季扬娜、19岁的玛丽亚、17岁的阿纳斯塔西娅，还有13岁的沙俄皇太子阿列克谢，全都被接到处决命令的尤洛夫斯基和秘密警察枪杀。
当第一轮枪响后，有三个公主没有死，因为她们身上穿着藏满了钻石、珠宝的胸衣，行刑队用刺刀结束了几位美丽公主的生命。尸体被行刑人员浇上硫酸和汽油焚毁，然后，被埋藏在叶卡捷琳堡附近的一个洞穴中。罗曼诺夫家族统治俄国三百余年，其王朝在欧洲统治期是最长的。除了个别逃亡到西欧的皇室成员和贵族，留在俄国内所有皇族成员都被血洗，无一幸存。
为何一定要处决沙皇一家？当时红色政权成立不久，正处于内战时期。而沙皇一家成员都是成功复辟皇权的最佳象征，当时，俄国白军也一直在寻找沙皇一家人的下落，如能解救他们，那沙俄白军就能够迅速获得欧洲多个国家和保皇势力的支持。而沙皇家族只要有成员活着，必定会被欧洲其他皇室扶持成立流亡政府，如此一来，则必将会严重威胁红色政权的合法性。
1991年7月，沙皇家人及仆人的九具遗骨被发现。经过DNA技术繁琐的验证，最终确认他们就是末代沙皇夫妇、三位公主及四位仆役的遗骸。
1998年，在沙皇一家死后的八十周年，当时的俄国总统叶利钦下令，将沙皇尼古拉二世家族的遗体运至圣彼得堡，并举行国葬，安葬在彼得保罗大教堂，和沙皇历代皇室的先祖们葬在一起。2000年，俄罗斯东正教会追封尼古拉二世家族为殉教圣徒。
2007年，沙皇家族中，另有两具烧得焦黑的骨骸被找到，经过DNA验证后，确认是皇太子阿列克谢和三公主玛丽亚。他们也被重新隆重下葬，于父母与姐妹们长眠在一起。当年，末代沙皇尼古拉二世全家都被处决，是欧洲皇室历史上最血腥的灭门惨剧。
2008年10月1日，俄国最高法院为尼古拉二世正式平反，宣布他的家族是当年苏联镇压下的政治牺牲品和受害者。俄国正式推翻了九十年前，布尔什维克有关处决罗曼诺夫皇族是“罪有应得”的观念。并正式恢复末代沙皇尼古拉二世全家的名誉。
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