打开APP
userphoto
未登录

开通VIP,畅享免费电子书等14项超值服

开通VIP
step by step轻松获取环状RNA(circRNA)序列

2.对照搜索结果,对circRNA信息进行核对,下图可以看出人的foxo3基因组序列上对应两个circRNA,分别是hsa_circ_0130221和hsa_circ_0006404。

3.上述搜索结果表格中的蓝色字体标记的文字都包含超链接,可以进一步点开查看详细信息。这里我们点击hsa_circ_0130221,跳转其详细信息界面。
4.点击hsa_circ_0130221下行的Position,则跳转UCSC基因组浏览器界面。下图即可形象地展示FOXO3相关circRNA hsa_circ_0130221的基因组信息了。
这里我再给大家留个小小问题,拓展下思路(说不定文章思路就存在里面哦,留到以后我们再详细探讨)如果我们再点开FOXO3相关的另一个circRNA hsa_circ_0006404 看看跟上面的circRNA有什么区别?
5.要获取hsa_circ_0130221环状RNA的序列,点击hsa_circ_0130221那条粗直线就OK(如下图)
跳转至hsa_circ_0130221详细信息界面
进一步点击上图红框标记区.

6.点击get DNA,到这个地方终于见到hsa_circ_0130221的DNA序列庐山真面貌了,那么就可ctrl a,ctrl c,ctrl v保存到记事本里了。


说了这么多,那么请收藏circBase这个神奇数据库的网址吧(http://circrna.org/)

参考文献:

1.Hansen T B, Jensen T I, Clausen B H, et al. Natural RNA circles function as efficient microRNA sponges[J]. Nature, 2013, 495(7441):384-388.

2.Guo J U, Agarwal V, Guo H, et al. Expanded identification and characterization of mammalian circular RNAs[J]. Genome Biology, 2014, 15(7):1-14.

3.Guo J U, Agarwal V, Guo H, et al. Expanded identification and characterization of mammalian circular RNAs[J]. Genome Biology, 2014, 15(7):1-14.

4.Chen I, Chen C Y, Chuang T J. Biogenesis, identification, and function of exonic circular RNAs.[J]. Wiley Interdisciplinary Reviews-rna, 2015, 6(5):563–579.


关注“circRNA”公众号

掌握环状RNA最新科研进展;探讨环状RNA最新研究技能。“circRNA”是目前国内首家关注人数最多,最受欢迎的以“circRNA”为主题的科研交流平台,为科研同行提供最新科研讯息!

本站仅提供存储服务,所有内容均由用户发布,如发现有害或侵权内容,请点击举报
打开APP,阅读全文并永久保存 查看更多类似文章
猜你喜欢
类似文章
【热】打开小程序,算一算2024你的财运
使用IRESfinder分析环状RNA的蛋白编码潜能
科研服务 | II型糖尿病circRNA Biomarker研究新成果
四月份环状RNA研究汇总
环状RNA中谁才是肝细胞癌的明星标记物?
看点啥|检测血浆中这种稳定的环状RNA可能是一种临床上有用的、简便的胃癌诊断指标
哈尔滨医科大学:新型环状RNA circ-CCAC1促进胆管癌进展、诱导血管生成并破坏血管内皮屏障
更多类似文章 >>
生活服务
热点新闻
分享 收藏 导长图 关注 下载文章
绑定账号成功
后续可登录账号畅享VIP特权!
如果VIP功能使用有故障,
可点击这里联系客服!

联系客服