生信人绘制火山图工具介绍

本工具专门用来绘制火山图，可以自由定制颜色，横轴纵轴的最大最小值，导出发表级的图片。

软件输入只需两列，一列为foldchang（有没有做log2转换即可），一列为p值（有没有log皆可）

软件界面如下：

导出PDF结果如下：

火山图绘制工具下载链接：http://gap.shengxin.ren/tool/5/（点击阅读原文前往下载）

1、首先我们选择一套GEO数据集GSEXXXX,然后使用GEO2R的在线工具（或者使用生信人的差异分析小工具*看这里：如何极其简单的使用GEO数据来做差异分析）筛选差异表达基因，我们将得到所有基因的差异表达情况，比如GEO2R输出的GEO2R processing request....txt文件。

文件格式：

2、打开火山图绘制工具软件

3、导入数据点击绘制

4、改改颜色，改改CutFC或者CutPvalue，还有X,Y轴的最大最小值，反正都可以试一下

5、导出PDF,就好了，最终结果如下：