基因富集大家最常用的软件是David，那么有没有其他更好用更直观的工具呢？答案是Yes！其实David的数据更新一直比较慢，2016年前大家用的David 6.7版本是数年前发布的，而David 6.8一直到去年的10月才发布。
我们给大家介绍一个新工具，叫做Metascape，使用更简单，结果更酷炫！
这 个工具的最新数据库更新是在2017年的3月，如果你担心这个工具的权威性，查一下2017年发表在Nature Microbiology上的 Systems-based analysis of RIG-I-dependent signalling identifies KHSRP as an inhibitor of RIG-I receptor activation. 这篇文章的基因富集就是使用了Metascape这个工具！
那么还有什么好处呢？那就是图啦！这个工具甚至可以帮你生成一份PPT，里面是全部的分析结果包括图表！
悄悄告诉你，这些酷炫的图表就是用Metascape做的！
下面来看看怎么使用吧！
（1）访问 http://metascape.org
（2）把标准的基因名的列表贴到页面上的窗口里，就像下面这样：
然后点击粘贴基因列表框下的蓝色按钮“Submit”按钮。
（3）Submit后，需要选择这些基因所属的物种，如果我们研究的是人类的物种，那就选择H.sapiens即可。
（4）选择进行富集分析，即点击“Express Analysis”按钮，页面会显示分析的进度条，就像下面这样：
（5）静静等待分析结束，然后点击下图中的Analysis Report Page的按钮。
（6）一气呵成！慢慢享受分析结果吧！
这是你上传的基因富集在哪些通路上的结果，还可以点击PDF下载高清图片。
这是PPI和Network的结果。
最后，告诉大家一个好用的！点击页面顶部的下载报告PPT按钮，就会得到一份非常详尽的包含所有图表的PPT喔！
想学更多这类实用工具？那就快来参加由宇道生物和上交大医学院生信中心共同举办的《实用生物信息学培训班》吧，为您的文章和基金补充生信分析内容，结果更丰满，图表更漂亮：）
只做了一部分预实验，如何使用生物信息学方法为自己的观点提供更多证据？
常见的基因信息、蛋白信息、蛋白-蛋白相互作用信息如何查找？
GO/KEGG分析是怎么做的，结果有什么用？
非编码RNA的研究中有哪些生物信息学工具和方法可以现学现用？
在公司做了二代测序实验，完全看不懂生物信息学分析报告…测序公司给我分析了好多差异蛋白/突变，接下去怎么办？
本次培训班由宇道生物和上交大医学院医药生物信息学中心联合打造，上课老师经验丰富，课程设计合理，专治各种迷茫，30人以下小班教学，名额有限喔！
培训概况
【主办单位】
上海宇道生物技术有限公司/上海交通大学医学院医药生物信息学中心
【培训地点】
上海交通大学医学院（上海市重庆南路280号4号楼103）
【课程时间】
2017年12月01日 - 12月03日（报名中）
【课程人数】
精品小班，每期不超过30位学员！
温馨提示：请学员携带笔记本电脑参加。
课程安排
时间
授课内容
第一天
8:30 – 9:30
基金写作中的生物信息学方法概论
9:45 – 11:00
基因、蛋白常规信息的查询（常规数据库使用，各类基因、蛋白ID的转换）
11:15 – 12:15
基因表达量的在线查询
常见组织、细胞系、肿瘤/癌旁的表达量查询方法
（从自己样本的实验中找到的大量差异基因如何再利用公共数据库做进一步筛选）
12:15 – 13:30
午餐
13:30 – 15:00
序列比对、蛋白三维结构查询与结构比对
15:15 – 17:15
如何将SNP/突变在蛋白结构上标记展示作图并推断其可能的功能
从自己的实验中找到的SNP/突变如何查看其在大样本公共数据库中的突变频率
第二天
8:30 – 10:00
GO分析怎么做，GO分析的结果图的含义及如何使用
（测序报告中的GO分析结果的含义）
10:15 – 11:45
基因通路信息检索方法与软件（kegg的结果有啥用，该如何进一步分析，测序分析报告中KEGG结果的含义）
12:00 – 13:30
午餐、休息
13:30 – 15:30
GEO数据库的在线使用（如何调研自己的差异基因在其他人的芯片结果中是否有差异）
16:00 – 17:30
GEO的paper实例讲解 （看看别人如何用GEO的数据结果发表文章）
第三天
8:30 - 9:30
非编码RNA（lncRNA, circRNA, miRNA等）的生物信息学分析方法
9:45 - 12:00
实例讲解: 使用在线工具对非编码RNA （lncRNA, circRNA, miRNA等）进行生物信息学分析
12:00 – 13:30
午餐、休息
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