蛋白质组学听课笔记汇总贴

前言

话说，自从去年年底，小编参加了克里克学院组织的蛋白质组学网络大课堂以来，感觉已经作为酱油成员，登上了蛋白质组学这艘航母，内心是有点小窃喜的~

更让小编开心的是，先后分享出来的十三篇听课笔记，到目前为止一共被阅读了上万次，还有很多小伙伴给小编留言，要么赞扬，要么鼓励，要么一起探讨里面的知识点，让小编觉得码字的所有辛苦都是值得的！

这些听课笔记，是网络课堂的前四堂课的核心知识点，正好从综述、实验、仪器及数据分析四个层面，比较完整地介绍了当前蛋白质组学的基本轮廓和框架。

为了让大伙儿点贴更方便，小编把这十几篇听课笔记做了一个汇总，大伙儿如果想留着慢慢看，重点收藏这个帖子就可以啦~

课程总结

第一课

1

>> 听课笔记之蛋白质组学研究方法概述（上）

知识点：

--基于质谱的蛋白质组学：质谱技术的前世今生

--蛋白定性检测：背景介绍、二级质谱、鉴定碎片离子

2

>> 听课笔记之蛋白质组学研究方法概述（下）

知识点：

--蛋白定性检测（续）：搜库工具、搜库流程、鉴定结果评估

--蛋白定量检测：基于MS1的定量、基于MS2的定量

--靶向蛋白质组学：SRM/MRM、DIA

第二课

1

>> 听课笔记之蛋白质组学样品前处理（一）

知识点：

--样品前处理的目的

--样品的收集与保存：组织样品、细胞样品、血清样品

--样品的破碎：机械破碎、物理破碎、化学处理

2

>> 听课笔记之蛋白质组学样品前处理（二）

知识点：

--动物组织样品的处理步骤

--动物细胞样品的处理步骤

--石蜡包埋样品的处理步骤

--植物组织样品的处理步骤

--细菌样品的处理步骤

--体液样品的处理步骤

--亚细胞器蛋白的提取方法

3

>> 听课笔记之蛋白质组学样品前处理（三）

知识点：

--蛋白提取的质量控制

--脱盐的处理方法

--还原烷基化及酶解的步骤

--蛋白质及肽段的预分级

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>> 听课笔记之蛋白质组学样品前处理（四）

知识点：

--自动化样品前处理的新方法一：StageTips

--自动化样品前处理的新方法二：PCT压力循环系统

第三课

1

>> 听课笔记之蛋白质谱的原理及使用（一）

知识点：

--什么是质谱仪

--质谱仪的分类介绍：磁质谱仪、飞行时间质谱仪、四级杆质谱仪、离子阱质谱仪、FTICR和Orbitrap

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>> 听课笔记之蛋白质谱的原理及使用（二）

知识点：

--质谱仪性能参数：检测限、线性范围、分辨率和质量准确度

--串联质谱类型及工作原理

--质谱辅助系统

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>> 听课笔记之蛋白质谱的原理及使用（三）

知识点：

--液相色谱仪及组成

--液质联用技术

4

>> 听课笔记之蛋白质谱的原理及使用（四）

知识点：

--质谱仪的使用与维护

--纳升液相系统的使用与维护

--液质联用系统的检查和保养

--质谱运行状态的评估

第四课

1

>> 听课笔记之蛋白质组学数据分析基础（一）

知识点：

--质谱数据格式

--结果报告的质控

--DDA模式的工作原理

2

>> 听课笔记之蛋白质组学数据分析基础（二）

知识点：

--同位素对质谱分析的影响

--原始谱图的处理

--什么是b-y离子

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>> 听课笔记之蛋白质组学数据分析基础（三）

知识点：

--DIA数据非依赖性采集

--搜库原理及技巧

--蛋白质组学相关的数据库及使用方法

致谢