Graphpad绘制柱形图＆散点图

作者：曾阿牛

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上图是Neuron 2016 (IF=13.974)年十月发表的一篇文献中的图，右图的统计图是左图Western条带Nuak1水平柱状图和散点图共存图。这种表现形式的优点是既能够很好显示数据的均值（Mean）和标准差（SD）或者标准误（SEM）又能以散点显示数据的分布。那么如何绘制这种柱状图和散点图共存图呢？

接下来我们使用Graphpad Prism 7.0（win7，64位系统）给大家分享如何绘制柱状图与散点图共存图。

步骤如下：

Step1

打开Graphpad Prism 7.0软件，在New table ＆ graph中选择Column（列），Enter/import data有三种数据输入方式，在此我们选择Enter replicate values，stacked into columns（输入平行数据使之成列）。其他两个选项分别为输入配对的重复测量值和输入已经计算好的均值和误差值。

注：绘制柱状图与散点图共存图不能使用第三种输入已经计算好的均值和误差值输入方式，因其本身只有均值和误差值，故不会显现数据分布的散点图。

新建数据Data1界面如下：

Step2

输入数据列，共5列

在Graphs下点击Data1进入Change Graph Type界面。Graph family下可以选择XY,Column……Column bar graph 默认显示Mean with SD，可以根据需要改为SEM。Preview下可以看见Data1绘图的效果，右边的三角形可以切换不同图形的预览。

选择柱状图和散点图共存图，Scatter plot with bar，Plot： Mean with SD（可根据需要选择）。柱状图和散点图共存图在此有两种方式可以选择一种是垂直的柱状图与散点图共存图，另一种是水平的柱状图散点图共存图，我们在此以垂直的柱状图与散点图共存图为例。

水平的柱状图散点图共存图：

Data1垂直的柱状图与散点图共存图最初效果如下：

我们可以看到最初效果中数据列名称A、B、C……为倾斜45°角模式。

双击列名称，进入Format Axes界面，可以看见Location of numbering/labling 此时为Below，angled（向下，角度），角度为45°。

有以下几种选择方式：

None无标记:

Above标记朝上；Below，horizontal 朝下，水平；Below，vertical 朝下，垂直；Below，angled 朝下，角度（可在Numbering/labeling angle选择角度大小）。

Step3

进行美化修饰，修改纵坐标为Recognition Index（RI）

双击散点，进入Format Graph界面，选择Data set，Global，change all data sets （选择所有数据列）

将所有散点的Symbols Shape改为圆形，Size由4改为3。

效果如下：

双击散点，在Format Graph的Data set中分别选择Data1：A，Data1：B……更改其对应的颜色。Error bars 统一改为蓝色（9 E）。

Step4

Export导出图片，选择导出为TIF格式，背景颜色为White，分辨率为600 dpi，Color Model选择RGB（millons of colors，24 bits），Size Make width为8 cm。

水平的柱状图散点图共存图的操作步骤与上述相同。