【数据挖掘专题四】寻找差异表达的基因

我们在专题二中讲了如何应用GEO2R的在线工具来帮助寻找差异基因，今天小编再教大家一招，如何使用gene spring来再次实现这个功能。那么我们打开上一节最后生成的界面，如图。

接下去我们先要对所有的样本进行分组，只有分了组，才能进行比较。首先我们点击右上角的Experiment grouping，然后选择Add Parameter。

这里Parameter name中我们命名为group，参数类型选择非数值型。

现在总共有32个样本，假设我们分为两组，分别为control和drug。先选择前16个样本，然后点击Assign value，出现对话框后我们命名为control。

同样道理，我们用同样的方法给后16组命名为drug。如图，点击OK。