在开始生酮饮食前，需要详细的病史和检查，以评价发作类型；排除生酮饮食的禁忌症；估计易导致并发症的危险因素（如：存在肾结石、家族性血脂异常、严重肝脏疾病、慢性代谢性酸中毒、进食困难等）；另外要注意患者目前所服药物是否含糖，必要时更换。因此在进行初期，需要完善以下检查。
| 病史 | 实验室检查 | 特殊检查 |
| 发作（类型、频率） | 全血细胞计数 | 脑电图 |
| 相关疾病 | 血电解质、血肌酐 | 肾B超 |
| 用药（癫痫药） | 血转氨酶 | |
| 饮食习惯 | 血乳酸,血氨 | |
| 普通儿科检查 | 血肉毒碱 | |
| 神经系统检查 | 血 脂 | |
| 血药水平 |
●低血糖
如果患者能产生酮症的话，一般都能耐受低血糖，如果出现神经系统症状的过分低血糖，可口服适量碳水化合物（如100－200ml橘子汁）。
●过分酮症
查血气分析，如果PH正常，继续生酮饮食。如果PH低（非代偿性酸中毒），降低生酮饮食的比例或口服适量碳水化合物（如100－200ml橘子汁）。
●酮症不足
检查是否有食用其他碳水化合物（如牙膏，饮料，含糖药物等）
●恶心/呕吐
查血气分析，如果PH低且酮体高（非代偿性酸中毒），处理见上（过分酮症）；如果酮体低，查血糖。
●困倦或嗜睡
一般为短暂性的，能在1－2周内消失。注意有无合并应用其他致嗜睡的药物（如鲁米那，安定）。
●神经系统症状：发作增加或无效
如在开始生酮饮食的早期即出现发作增多，需考虑立即停用。如果酮体在所需范围，而发作无减少，应用1-3月后，确认无效，可予葡萄糖终止生酮饮食。如果发作时间很长，予安定5－10mg静推。
☆随访
在开始的阶段应与家属保持较密切的联系，直到家属对该疗法较有信心且可以稳定维持。以后可以3－6月随访一次。随访的项目包括对患儿营养状况的评估，根据身高、体重和年龄调整食物热量和成分，检测副作用，进行必要的实验室检查。（参考表5。）2岁以下或有营养障碍的患儿还应增加随访次数。 坚持服用1-3月，再评价生酮饮食是否有效。
☆停止生酮饮食
如果无效，应逐渐降低生酮饮食的比例，如由4：1至3：1至2：1，直到酮症消失。 如果有效，可维持生酮饮食2－3年。有报道最长服用超过10年。然后可逐渐停用。方法是每2－3月降低一次生酮饮食的比例，直到酮症消失。对于Glu-1、PDH缺乏症和结节性硬化的患者应延长治疗时间。对于发作完全控制的患者，80%的人在停止生酮饮食后仍可保持无发作。复发的危险因素包括；脑电图的癫痫放电、神经影像学的结构异常，结节性硬化。在减量过程中出现发作复发增多时，可重新回到原来的比例，大多数患者（58%）可以重新获得发作控制。 生酮饮食并不一定要求最终停止，有些家属坚持一直采用此方法进食。对于年长的儿童和青少年难以耐受4：1的比例时，降低比例为2：1或1：1维持进食有时也是有效的方法。
☆副作用
生酮饮食并不是完全没有风险的，应综合评价癫痫发作及大量抗癫痫药物对患儿的影响与生酮饮食副作用的利弊。
总体来说，严重的副作用很少，即使有一些轻微的副作用，大多数患儿也不需停止，但医生仍有必要对以下的副作用进行监测。
☆常见的短期副作用有：
2 呕吐
3 低血糖
4 酸中毒
5 困倦
6 脱水
7 拒食
这些副作用多是一过性的，可以有效处理。
☆远期副作用主要有：
1肾结石
发生率：5－6％。
诊断：肾B超或通过血尿发现
治疗：避免液体限制
碱化尿液（枸橼酸钾）
碎石（很少需要）
停用碳酸酐酶抑制剂（如乙酰唑胺，妥泰）
2便秘
发生率：经常发生
诊断：临床表现
治疗：增加纤维摄入
增加液体摄入
3 脂肪增高
诊断：脂肪增多的体形
治疗：降低生酮饮食的比例
升高多不饱和的脂肪酸的比例
如果血脂一直升高又没有其他明确的可解释原因，建议筛查父母血脂
4 生长障碍
诊断：对照正常儿童生长表格；骨龄测定
治疗：增加蛋白质、维生素和矿物质摄入，尤其是钙。
5 骨代谢异常和骨折
诊断：监测血钙、甲状旁腺素和骨密度
治疗：增加合适的钙质补充
其他生酮饮食治疗期间曾报道的副作用
| 副作用 | 样本：1066例 | 发生率％ |
| 呕吐 | 59 | 5.53 |
| 血脂升高 | 28 | 2.63 |
| 酸中毒 | 20 | 1.88 |
| 腹泻/便秘 | 20 | 1.88 |
| 血尿酸增高 | 19 | 1.78 |
| 肾结石 | 12 | 1.33 |
| 低血糖 | 9 | 0.84 |
| 感染率增加 | 8 | 0.75 |
| 胆结石 | 4 | 0.38 |
| 脱水 | 3 | 0.28 |
| 肝酶升高 | 2 | 0.19 |
| 蛋白丢失肠病 | 2 | 0.19 |
| 胰腺炎 | 1 | 0.09 |
| 死亡 | 20 | 1.5 |
| 死亡原因 | 报道的死亡例数 | |
| 感染 | 3 | |
| 脂质性肺炎 | 3 | |
| 心跳骤停 | 2# | |
| 呼吸骤停 | 2 | |
| 癫痫持续状态 | 2 | |
| 胃出血 | 1 | |
| 代谢衰竭 | 1# |
# 每种病因各有1例诊断为丙酮酸脱氢酶缺乏症
●禁食或不禁食
在生酮饮食的启动期，禁食并不是必须的，它只不过能更快的使患者达到酮症，如果临床需要完全可以不禁食。
●液体限制
早期的文献曾推荐限制液体摄入对生酮饮食的重要性，但目前其作用还未完全明确。且它可能增加肾结石的风险，故多数癫痫中心不推荐液体限制，而推荐在一天中少量多次饮水。
●肉碱（carnitine）的补充
左旋肉碱是脂肪酸代谢必须的辅助因子，它促进并参与机体脂肪代谢，保护细胞膜的稳定性，具有多种重要的生理作用，是世界卫生组织推荐的特殊氨基酸类维生素之一。曾有文献报道在生酮饮食中产生继发性肉碱缺乏症，产生虚弱、无力、肌张力降低等症状，虽然不多，但多数癫痫中心常规进行肉碱浓度监测或常规补充(100mg/kg/d)。
●与其他抗癫痫药物合用的问题
生酮饮食与抗癫痫药物的相互作用目前了解不多，尚未见到生酮饮食与抗癫痫药之间有明显相互作用的报道，生酮饮食也不会影响抗癫痫药的血药浓度。苯巴比妥、苯二氮卓类可能疗效加强。 但在启动生酮饮食的时候，一般要求继续维持原有的抗癫痫药。
理论上认为丙戊酸作为一种短链脂肪酸可能会加强脂肪酸的氧化，加重肝功能损害的风险，但最近的临床研究(Lyczkowski et al.)证实两者合用是安全的。
生酮饮食会产生一过性无症状性酸中毒，与碳酸酐酶抑制剂（乙酰唑胺、妥泰、唑尼沙胺）合用时更易降血低血碳酸氢盐浓度，因此，在治疗早期，有必要监测血碳酸氢盐浓度，产生明显症状（如呕吐、虚弱）时要适当补充碳酸氢盐，尤其是与碳酸酐酶抑制剂合用时。因此在生酮饮食有效后我们可以首先考虑停用这些药物，但在开始生酮饮食的启动期则无此问题。如果生酮饮食治疗确认有效，可以考虑在1-6月内逐渐减少/停用抗癫痫药，但不要同时停用所有药物，应一次停用一种药物。如果药物副作用大，也可更早期停用。但在停用苯巴比妥和苯二氮卓类药物时要注意缓慢，因为停用它们更易引起发作反跳。
●在婴儿中的使用
1岁内的患儿更易产生营养障碍和长期副作用，但也较易接受乳化的生酮饮食。因此对患儿需要更好的观察其神经生长发育，最好留在有生酮饮食经验的癫痫中心内开展。
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