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结构生物学解锁新冠肺炎病毒

019新型冠状病毒疫情大流行,目前全球确诊个案已破160万例、逾9万人不治。

科学家积极研发疫苗和解药,对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)进行研究,

首重了解病毒分子间的确切的形状和结构,才有机会研发出解药和疫苗。

先前的抗流感药物,例如:特敏福(Tamiflu)和瑞乐沙(Relenza),都是透过解构病毒的方法,才研发成功。

因此,科学界对于研发新型冠状病毒解药和疫苗,也抱极度乐观的态度。

据上报今天报道说,结构生物学扮先锋,解锁新冠肺炎病毒。

消息说,目前科学家已透过结构生物学,了解新冠病毒的棘突蛋白的外观,是药物疫苗研发一大突破。

该报道说,有人声称,抗疟疾和自体免疫疾病的用药奎宁(chloroquine),可用于治疗新冠肺炎。

但实际上,并没有任何处方笺对新冠肺炎有实质性的治疗效果。

为了抗病毒药物的研发,制药公司针对感染新冠病毒后痊愈之病例,寻找人体产出的抗体。

此外,也积极发展适用于健康人体的病毒疫苗,透过使用遗传物质或合成病毒蛋白,希望能启动人体本身的免疫系统,可以自行对抗病毒。

其中一些实验性药物和疫苗,已经进入人体实验的阶段。

一段时间后,我们可以知道这些药物是否有效。

但可以肯定的是,目前仍需要投注大量的资金和时间,直到新冠病毒药物和疫苗研发成功。

就结构生物学提供新冠病毒研究方法,该报道称,结构生物学能让我们看见奈米尺寸的分子,例如DNA,RNA和蛋白质。

目前科学家使用X射线晶体学,和低温电子显微术等结构生物学方法,来检视病毒的分子结构组成。

日前,结构生物学家已经研究出新型冠状病毒的蛋白组成,而病毒自身的棘突蛋白(spike protein)

(帮助病毒进入宿主的蛋白),和能够使病毒复制的酶(enzyme)成为了目前制药公司研究的重点。

透过结构生物学数据,科学家能寻找病毒蛋白内的特殊特征,此特征通常为可以容纳小的化学分子的空间。

一旦鉴定此特征后,即可致力于研究该分子,改善其适应性,并使其作为药物发挥治疗作用。

最后,希望化学分子可能足够紧密地贴合在一起,以阻止病毒蛋白发挥作用,就像将扳手扔入一组齿轮中一样。

据该报道指,这种研发新药和标靶药物的方法称为“基于结构的药物设计”(structure-based drug design),

因过去已成功透过此方法,研发出抗流感药物特敏福和瑞乐沙,因此可以知道此方法省时、高效且精确。

对于疫苗设计和治疗方法的开发,了解新冠病毒的棘突蛋白的外观是一个重大突破。

他们目前也计划使用这个蛋白质,来监测痊愈病例产生的抗体。

现代的科技、仪器和数据搜集,已经让结构生物学的数据提供管道更多元快速,相较于5年前的技术,根本无法做到现在的程度。

目前收集到的结构数据存放在蛋白质数据库(PDB)和电子显微镜数据库(EMDB),

两个数据数据库都在网络上并开放全球免费使用,希望全球的科学家能够合作,

解答有关新冠病毒的问题,并找到药物设计的最佳方法。

上报报道称,无论是开发新药还是疫苗,结构生物学都是了解从病毒到人类的分子机制的第一线。

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