打开APP
userphoto
未登录

开通VIP,畅享免费电子书等14项超值服

开通VIP
超好用的基因功能分析网站!

关于基因功能注释(GO和KEGG之类的)我们已经介绍过很多,DAVID大概是最常用的工具了,但其更新速度一直遭人诟病。。。今天给大家介绍一个非常好用的网站Metascape(http://metascape.org/gp/index.html#/main/step1),虽然打着Meta的名号,却是一个基因功能注释分析的网站~~~


先给大家演示一套最为常规的流程(默认的自动分析)

首先上传基因list,可以是文件,也可以直接复制粘贴到下面的框里


选好物种 ,进行分析就可以了


结果就全都在这个报告页面里了


基因功能富集分析


基因信息注释


基因功能聚类网络图


我们来看一下自定义分析有哪些内容


首先是基因ID的转换和注释


Enrichment里就是我们常见的基因功能富集,我们前面看到的那个条形图和我们平时做的KEGG和GO功能富集不同,就是因为下面这些自定义选项的不同,这里我们也可以改成平时熟悉的KEGG和GO。


接下来就可以导出结果,All in One Zip File里包含全部的分析结果


GO和KEGG注释结果都是这个EXCEL表格里


在基因功能富集中还做好了可视化结果(这个结果类似于Cytosacpe插件ClueGO的分析结果,不过Metascape没有显示具体的Term名称)


PPI网络分析里甚至给你做好了MCODE的亚网络分析!


好了,这么好用的工具赶紧上手吧!最后祝大家五一假期玩得开心!


本站仅提供存储服务,所有内容均由用户发布,如发现有害或侵权内容,请点击举报
打开APP,阅读全文并永久保存 查看更多类似文章
猜你喜欢
类似文章
【热】打开小程序,算一算2024你的财运
富集分析DAVID、Metascape、Enrichr、ClueGO
基因通路富集分析方法大总结
GO和KEGG富集分析(Metascape数据库)
网络药理中基因富集分析(GO、KEGG)图一键生成神器——Metascape
转录组不求人系列(十二): Cell文章最喜欢用的差异基因GO、KEGG富集分析工具
GO分析和KEGG分析都是啥?
更多类似文章 >>
生活服务
热点新闻
分享 收藏 导长图 关注 下载文章
绑定账号成功
后续可登录账号畅享VIP特权!
如果VIP功能使用有故障,
可点击这里联系客服!

联系客服