猪流行性腹泻（PED）是由猪流行性腹泻病毒（PEDV）引起的一种以腹泻、呕吐、脱水为主要特征的一种急性、高度接触性的猪肠道疾病。该病主要危害哺乳仔猪，通过粪口传播导致7日龄仔猪发病率和死亡率接近100%。
该病于1971年在英国和比利时首次报道，随后在其他欧洲国家和亚洲的多个国家流行爆发，给养猪业造成了严重的经济损失。
在2010年之前的时期内，来自经典亚群（GIa）的PEDV株在东亚造成了广泛流行。2010年以来，随着新毒株的出现，GIIa亚群PEDV毒株导致大规模PED疫情，给亚洲养猪业带来了巨大的经济损失。
2013年以来，在北美出现了一种被归类为G2b亚群的高毒力PEDV，此后不久，它迅速席卷了全球多个国家。G2b毒株暴发后，在美国出现了S基因缺失和插入的新变体，这些变体被归类为S-INDEL亚群。自2010年以来在中国发现的PEDV毒株如CH-SCMY-1/2014、CH-SCZY103/2017、CH-HNLH/2015、CH-JXJA/2017一起被分为一个不同的亚群，命名为GIIc亚群。
接种疫苗是控制PED的重要方法。自1994年以来，已开发出PEDV CV777株灭活和减毒活疫苗，灭活和减毒PEDV疫苗已在中国猪群中广泛应用，在控制PEDV感染方面发挥了重要作用。
然而，大多数减毒疫苗是由G1a株生产的，对2013年以来出现的高致病性株的保护作用减弱。除了经典菌株的传统疫苗外，基于AJ1102毒株的PEDV灭活疫苗和减毒疫苗，即PEDV疫苗中使用的第一个G2b毒株，于2017年12月成功上市并广泛使用，从而更有效地控制了该疾病。
然而，近年来的流行病学调查报告表明，PED仍然是困扰养猪业的主要疾病之一，主要原因是PEDV作为一种冠状病毒，其极易发生重组和变异，导致现有疫苗对其预防效果下降，GIIc亚群的出现和近期在国内主要生猪养殖区的流行给PED防控带来了新的挑战。
2017年至2021年，对中国16个省的303个农场收集的882份死亡仔猪粪便和小肠样本进行RT-qPCR分析显示：五年内，52.15%（158/303）的检测农场PEDV核酸呈阳性。五个地区农场的阳性率从46.94%到55.00%不等。在882份样本中，共发现564份PEDV阳性。样本水平的阳性率从53.85%到68.51%不等，总阳性率为63.95%。
从毒株基因型看华东地区G IIc占比71.43%、西南地区G IIc占比19.05%、华北地区G IIc占比78.95%、华南地区G IIc占比93.75%、华中地区G IIc占比92.31%。综合来看G IIc毒株占比为68.27%，因此需要密切关注可能的大流行。系统发育表明G2c亚群是从重组事件进化而来的，S基因的5′部分是从G2b组获得的，3′部分基因组区域是从S-INDEL获得的。
具体信息详见表1、图1。
表1 2017～2021年中国PEDV流行分离株及其基因型分布
（数据引自国内某大型养殖集团已发表文献）
图1 不同基因亚群PEDV S1遗传进化树
通过对2017至2021中国PED临床腹泻样本分离到的PEDV测序的S基因S1片段与每个亚群的代表毒株进行比较，从遗传进化树来近年来新出现的GⅡc亚群与GⅡa亚群、GⅡb亚群遗传距离较远，且新出现的GⅡc亚群临床分离率最高，预测2022年秋冬季猪流行性腹泻的流行毒株很大可能以GⅡc亚群为主，提请国内生猪养殖者要重视PEDV GⅡc亚群的流行动态，并提前做好对PEDV GⅡc亚群田间流行毒株的针对性防范，尤其在疫苗的选用上，尽量选用近年来（2014年以后）的分离毒株生产的疫苗进行免疫预防，会有更为明显的效果！降低猪流行性腹泻造成的临床损失。
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