瘀病表现繁多。《医林改错》中所列的血瘀证涉及诸多方面、如“若血瘀，有血瘀之症可查，后有五十种血瘀证互相参考”。
王清任将血瘀证分为三类，一类具有血瘀特征者，如肚腹疼痛，积块痛处不移，或局部颜色改变，如白癜风、紫癜风、紫印脸、青记脸，或月经不调，经血淋漓不尽，其色或紫或黑，夹块或小腹痛。一类无明显瘀血征，但经观察及辨证，排除他症者，如患头痛，无表证，无里证，元气虚、痰饮等证，用活血化瘀法治愈。还有一类则是久治不愈，百法不效，用活血化瘀法治疗取效者，如忽然胸痛，用木金散、瓜蒌、陷胸、柴胡皆不应，用血府逐瘀汤一剂而痛止；自汗盗汗用补气、固表、滋阴、降火不效，用活血化瘀方而汗止。
王清任对某些疾病病机的认识与前人不同，如对发热病机的理解，王氏认为发热并非正邪交争所致，而是与血有关，是“邪向血内攻，血向外抗拒，一攻一拒；故寒热往来”。故虽无血瘀确征，却用化瘀法治疗，反映了王氏对瘀血证理解的深刻和独到，为临床扩大活血化瘀法适应证范围有很重要的指导意义。
提及血府，其瘀之表现不同。血府，是王氏学术之特色脏腑。《医林改错》中云：“血府即人胸下膈膜一片，其薄如纸，最为坚实，前长与心口凹处齐，从两胁至腰上，顺长加坡，前高后低，低处如池，池中存血，即精汁所化，名曰血府。”从中可以看出，王清任认为血府位于人体胸中膈上之间，其生理特点是化生血液，储存血液，通过营总管灌溉五脏六腑、四肢百骸。
血府血瘀，为血府之血的一种病理现象。血府乃储血生血之脏，奉精而化血，灌输血液于营总管而行全身。如有血瘀内阻于血府，闭结胸隔，瘀阻不行，其证非常复杂。故“惟血府之血，瘀而不活，最难分别”。王清任认为血府血瘀之证根本病位在血府，由于血府血瘀，旧血不去，新血不生，不能很好地为营总管输送血液，故可表现在神志、情欲、脏腑、头目、饮食上的病症，因此其症复杂多变。王清任辨证论治，立血府逐瘀汤，治胸中血府血瘀之症。
王清任尤其提及，由于血府瘀血部位之特殊，其发热表现与其他瘀血有别，后半日发烧，前半夜更甚，后半夜轻，前半日不烧，而且指出热势随瘀血之轻重而不同，治疗亦有别。如《医林改错》：“惟血府之血，瘀而不活，最难分别。后半日发烧，前半夜更甚，后半夜轻，前半日不烧，此是血府血瘀；血瘀之轻者，不分四段，惟日落前后烧两时，再轻者，或烧一时，此内烧兼身热而言；若午后身凉，发烧片刻，乃气虚参芪之症；若天明身不热，发烧止一阵，乃参附之症。不可混含从事。”王氏提示我们要据发热之特征诊断病因，而后辨证施治。-李艳彦《清代医家治血之论》