目前决策机制不再是领导拍脑袋个人独断了，任何一项决策的背后都少不了智囊团的支持，中国农业政策的制定主要是中央农村工作领导小组领导下，中国农业农村部具体执行外，有很多附属的智囊机构在背后提供着决策支持。主要是如下一些单位：
承办农村经济发展和体制改革、农业、林业、水利、农民收入、扶贫开发、粮食安全、生态文明等方面重大问题的调查研究，提出政策建议；起草、修改有关重要讲话和文件等文稿。
农村经济研究部的主要职责是：综合研究中国城乡协调发展、农村经济体制变革、农业和农村经济结构调整、农村经济和社会管理等农村改革和发展问题。重点研究领域有：农村经济运行与政策实施效果评估；农产品供求和农村市场变化、食品安全与监管、农产品对外贸易、农民收入与消费状况；农村土地制度改革、农村所有制结构调整与完善、农民合作组织发展；农村金融和农村公共财政体制改革；农业基础设施建设、生态环境建设、农业科技进步；农村非农产业发展、农村剩余劳动力向非农产业转移、农民工就业与权益保障、城镇化发展；农村教育、卫生与扶贫工作；农村基层民主制度与法治建设。农村经济研究部的研究特色是：重视农村实地调查、重视跨部门合作、重视国际交流与合作研究，研究成果及政策建议具有前瞻性，又具备现实可操作性。
中国农业科学院作为国家级农业科研机构，担负着全国农业重大基础与应用基础、应用研究和高新技术产业开发研究的任务，在解决农业及农村经济建设中基础性、方向性、全局性、关键性重大科技问题，以及科技兴农、培养高层次科研人才、发展农业科技出版事业、开展国内外农业科技交流与合作等方面发挥着重要的作用。主要负责政策的是农业经济与发展研究所、农业信息所，以及农业部下属的农村经济研究中心等单位。
中国农业大学经济管理学院设有五个系：农业经济系、经济贸易系、工商管理系、金融系、会计系；两个教育中心：中国农业大学MBA教育中心、实验教学中心；16个研究机构：中国农业大学期货与金融衍生品研究中心、中国农业大学食品安全政策与战略研究中心、农业经济研究所、农产品市场研究中心、农村金融与投资研究中心、国际农产品贸易研究中心、战略与决策研究中心、农产品流通与营销研究中心、中国农业模型与预测中心、物流规划与发展战略研究所、项目管理研究中心、农业保险与风险管理研究所、农户经济研究中心、国际应用经济研究中心、食物与健康经济研究中心、食品安全与消费研究中心。
此外还有中国人民大学农村发展学院、华中农业大学经济管理学院等国内主流农业院校的相关的学院。
中国社会科学院农村发展研究所（以下简称'农村发展研究所'）成立于1978年8月，原名为农业经济研究所，1985年更名为农村发展研究所,是专门从事中国农村问题研究的国家级学术机构，是中国社会科学院经济学部的主要研究机构之一。农村发展研究所的主要任务是：坚持以马克思主义为指导，综合运用经济学、管理学、社会学等理论方法，探索中国农村经济和社会发展规律，为党和国家农村发展政策制定提供咨询意见和建议，努力建设成为集学术研究、决策咨询、人才培养、编辑出版为一体，国内领先、国际有影响的国家'三农'研究中心、人才培养基地和新型高端智库。农村发展研究所的主要研究领域为农村经济形势分析与预测、农村发展理论与政策、乡村治理、农村组织与制度、城乡关系与发展规划、农村产业与区域经济、农村贫困与农民福祉、农村生态环境和资源保护、农产品市场与贸易、农村财政与金融、土地经济与农村人力资源、农村信息化与城镇化等。
北京大学现代农学院为学校独立建制的教学科研实体单位，重点发展农业交叉学科，着力解决农业现代化发展中的重大关键问题，突出办学特色。现代农学院致力于建设成'学、研、产、管'一体，集理论、应用、战略、政策、规划研究和中高端人才培养和培训、咨询为一体的，国际一流的现代农业技术与管理学院，为国家新农村发展建设提供基础理论支撑、前沿核心技术支撑、人才队伍支撑和政策咨询支撑。
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