利用PubReMiner汇总分析PubMed查询结果提高查询效率 | 科研动力

首先要进入http://hgserver2.amc.nl/cgi-bin/miner/miner2.cgi，界面如下。

在「Start remining PubMed for」输入 PubMed 检索式。PubMed 检索式如何编写？可以利用 PubMed 高级搜索功能编写。当然，如果您是检索大牛的话，对于 PubMed 检索式了然于胸，也可以直接编写。反正我不会，记不住那么多规则，我只会「Advanced Search」。

我以曾经检索过的一个检索式来说明一下。

把输入PubMed 检索式「(((HIV[MeSH Terms]) AND tuberculosis[MeSH Terms])) OR ((tuberculosis[MeSH Terms]) AND AIDS[MeSH Terms])」输入到「Start remining PubMed for」，其它默认即可。

然后「Start PubReMiner」，会得到一个界面。

在新界面中「Search with Manual Adjustment」

命中2821篇文献，可是默认显示的是1000篇。把「Abstract Limit」调成10000篇。

如果想显示快些，可以把右侧的「columns to display」不显示「mesh」「substance」和「word」。

之后会得到如下结果

PubReMiner 已经把所有文献按照发表年代，杂志，作者等分类了。

从这个结果中我们可以看到，发表此类文章最多是的Lancet，此类研究最多的大牛。当然第一个作者「ET AL」不是作者。

点击右侧的「P」，可以回到 PubMed 看到有关此项的研究。找个大牛看看。我们以第二位作者「CHAISSON RE」为例，点击右侧的「P」，可以看到CHAISSON RE所有的发表文献。这位大牛居然发表了318篇！牛人啊就是牛人。

在Google里搜索一下这位牛人

找到其主页

原来是Johns Hopkins University的一位教授，上面还有他的经历和发表文献。如果您想继续此方面的研究，可以考虑申请他的博士。

有的教授还有FaceBook主页，同样可以找，甚至E-Mail了，Tel了的，都可以找到，联系他吧。

重新搜索

点击需要添加的内容，在左侧选中，如我们只想看发表于 Lancet 和N Engl J Med的文章，选中之后再「Search Again」，会把只发表于Lancet 和N Engl J Med的文章筛选出来，通过上方的「Goto PubMed with query」，又可以回到 PubMed 看到这些结果的具体情况。

另外，还可以把汇总分析的结果导出为TXT文档，再通过Excel分析。

价值

面对当今信息过剩的年代，PubMed 上的资料也越来越多，我们无法知道哪些东西是有意义的。当然我们可以利用一些工具筛查一下文献，如：

利用医学文献助手筛查PubMed文献质量

利用PubMed Filters筛查文献质量

利用EndNote筛查文献质量

但是PubReMiner 的价值还不在于此，PubReMiner不仅过滤信息，把最好结果呈递给我们，而且还有许多更好的应用。我稍微总结了一下。

1、筛查 PubMed 信息。

2、提供研究趋势，可以根据发表年代的文献数量，看出这方面的研究是增加还是在减少。因此利用这个，可以初步考虑一下进行此方面的研究是否有价值。

3、提供投稿方向。根据相应发表此类文献的杂志，可以初步考虑一下向何种杂志投。当然发表此类文献最多的杂志是首选，因为编辑们对此方面感兴趣。如果一个杂志此类研究尚未发表一个，决定投此杂志之前要考虑一下了。

4、提供了世界上谁在做此类研究。根据作者信息，可以看到此类研究最多的大牛是谁。如果想外出深造，当然首选此类大牛。出研究成果的机率也就大大的增加。通过Google完全可以找到此位大牛在哪，有啥联系方式。唉，现今社会，人还有隐私吗？！

5、相比于Web of Knowledge免费，这点很重要。