黄连是毛莨科多年生草本植物黄连或云连等的根茎，又叫王连、支连等，气花皆为黄色，故名黄连。
《神农本草经》认为，黄连味苦性寒。能治疗由热邪或阳气亢盛引起的热性证候。可治疗目赤肿痛、眼角受伤、眼泪易出等眼疾。在治疗大肠湿热造成的腹痛、腹泻、痢疾等方面有显著的疗效。长期服用可以改善记忆力，消除健忘。
黄连是中药中最苦的一味药材，其根茎中含有大约7%的黄连素。中医认为黄连为苦寒药物，味苦能燥湿，性寒能除热，因此黄连能清热燥湿，尤其是清心、胃两经之火见长。临床上，黄连多用于热性病，治疗湿热之证，用于肠胃湿热导致的肠炎腹泻、细菌性痢疾。自古至今，医家认为黄连是治疗痢疾的上品。
由于黄连之苦是心肾之气相交，形成水火既济的最好状态，因此能有效地改善人的精神状态和记忆力。临床也用于治疗心火亢盛、心烦失眠等病症。同时黄连还是外科用药，凡痈肿、疔疮、丹毒、烧伤、烫伤、痔疮等热毒证均可使用。对于败血症的治疗也有明显的疗效。
但黄连药性大苦大寒，长期或过量使用会败坏胃气。但凡脾虚泄泻、胃寒呕吐的患者忌用或者慎用。
