教科书解释阴阳五行，是停留在哲学这个层面，比如《中医基础理论》，然而哲学和科学是有区别的。如果我们要简单地来刻画阴阳学说，从功能上来讲，它其实就是跟我们生理学上讲的兴奋与抑制两种基本的生理功能有相似之处。导致人体的兴奋与抑制的原因主要是活化与失活。在蛋白质与核酸层面的活化与失活，导致细胞、器官发生兴奋与抑制，从而使人整体上表现出兴奋与抑制，即阴与阳的两种状态。
我认为这样诠释人体是比较清晰的：从生理学的角度上去讲，中医讲人体是以气血精津液为基本原料，以经络为通道，通过相互协同与相互制约（相生相克）的五脏，使气血精津液发生运动与变化，就是我们中医讲的气化。气化活动最终表现为生理功能的兴奋与抑制，也就是中医讲的阴阳，从而完成生命活动与生殖活动。那么西医怎么说呢？西医说人体以氧、营养物质、糖、脂、蛋白质、维生素、微量元素为原料，通过八大系统（运动、生殖、神经、呼吸、消化、循环、泌尿、内分泌）的协同作用，发挥物质与能量的转化，并最终使人体的细胞与器官出现兴奋与抑制的状态，从而完成人体的基本生命活动。中医说的原料是气血精津液，西医说的原料是氧和营养物质；中医是以经络为通道，通过五脏的作用，西医是八大系统的作用；中医最终发生的是气血精津液的运动与转化，即气化，西医最终的变化是物质能量与信息的转化，即新陈代谢。
所以中医最终所体现出来的是阴与阳的两种功能状态，而西医说是生理功能的兴奋与抑制。我这里并不是说大家绝对要把中医西医这样拿来对比，我只是讲中医的认知，讲西医的认知，有道理也好，没道理也罢，大家就从中医西医的角度都去试听一下，希望有助于大家去理解。没有必要把中医的阴和阳完全与西医的兴奋与抑制相等同，大家也可以不这么说，但是听一听未尝不是一种解释，也未尝不对大家理解有那么一点点的帮助。
从西医的角度认识人体主要有三个学派：一个是结构学派，结构学派主要通过解剖去看，解剖看了不过瘾还通过光学显微镜去看，光学显微镜还看不清楚，再通过电子显微镜去看，进而形成了一个独立的学科；第二个是功能学派，它从系统、器官、细胞和蛋白质水平上去了解人体的功能，从不同的角度去了解人体功能，这就是功能学派；还有一个是信息学派，主要研究生物大分子，核酸、蛋白、多糖，它们怎么样传递生物信息的。核酸是一个三联制编码，它就是一个信息的主要分子，蛋白质也是。通过其量的变化和磷酸化传递生物信息。
所以我们研究阴阳，可以从三方面来研究：第一阴阳的物质基础是什么？它从基因蛋白，包括神经内分泌方面都可以表现为阴和阳物质基础的一些特性。所以阴阳一定是有物质基础的，它的物质基础可能不是某一个物质，很多物质都能够表现出影响我们机体生理功能，从而表现出阴与阳的特性！
第二个我们可以研究阴阳的功能，比如说是什么原因导致我们机体表现出兴奋与抑制的两种状态？可以从蛋白质、细胞和整体水平上去研究。也可以从物理学的层面去探讨。比如说你可以把物理阴阳理解为人类物质能量与信息的两种功能状态。比如说阴成形，阴成形是物质能量与信息的自组织过程，人是一个自组织构成的生物；阳化气，阳化气是物质和能量的耗散过程。我们的物质和能量不断的消耗，因为我们是一个活的人，就要消耗物质和能量。当然我们的物质能量又在不断地自组织，形成我们的细胞，形成我们的器官。阴平阳秘，它就是机体的这样一种有序状态。阴阳耗散结构理论，就是这么去认识阴阳的。
所以对阴阳的研究，一方面可以寻找营养物质的基础；另一方面从功能上去寻找阴阳的功能特征。我个人认为，只有把结构与功能有机地结合起来，才能更好的说明阴阳的本质，既有它的物质基础，又有它的功能状态。
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