后世治疗中焦虚寒而有热者，制有连理汤，即理中汤加黄连、茯苓。《张氏医通》言：“连理汤：治胃虚挟食，痞满发热。理中汤加黄连、茯苓。”方中干姜、黄连相配，有辛开苦降，治疗痞满之效。
连理汤可与附子理中丸对等相看。冉雪峰在《冉氏方剂学》中指出：“后贤加黄连，名连理丸，为中而兼上之治；加附子，名附子理中丸，为中而兼下之治。”
当代学者何绍奇指出：“理中汤加黄连方出丹溪《证因脉治》。张璐说本方主治'胃虚挟食，痞满发热’，戴复庵说'盛暑逼于外，阴冷伏其中’，俱难得其要领。我的理解，无非脾胃虚寒而又挟肠热，多年来用此方治疗泄泻屡收捷效。”
临床上，理中汤治疗中焦虚寒，黄连上可清心、中可清胃、下可清肠，故连理汤适用范围较广。