昨天我们安装好了R软件，不同时间安装的版本不一定完全相同，R的版本会持续更新，安装好之后我们会在桌面上看到两个R的图标。双击任意一个图标都可以打开R。
这节课我们学习R软件的运行与设置，R在windows系统安装后会出现两个图标，一个是R386，一个是R64，这两个一个是32位程序，一个是64位程序，二者差别主要对内存的支持不一样，32位只能支持3G的内存，64位系统对内存没有限制，所以大家如果处理甲基化芯片数据，由于数据量比较大，可以试试64位系统，更适合大数据的处理，也可以在开始按钮中程序列表中找到R的程序。
下面图形就是R的打开界面，在菜单栏有文件、编辑、查看、帮助等内容与windows其他软件类似，常用选项：文件-改变当前工作目录，编辑-gui选项-对界面进行设置，包括字体字号颜色等。
查看菜单选择是否显示工具栏和状态栏。
R毕竟是编程语言，所以所有选项都是可以用命令来完成的。
今天我们就涉及一小点命令，为了以后我们用起来方便，大家不用记住，经常使用自然就是熟能生巧了。
ls()
列出内存中所有选项
q()
退出R,系统会问y/n/c,提示保留空间退出，不保留空间退出，取消退出。
getwd()返回当前工作目录。
Rconsole 为R的控制台，我们的工作主要都是在这里完成。
R软件使用 > 作为提示符，R为交互式，我们输入命令，软件返回结果，例如我们输入1+1
回车，返回2。
max(1,2,3,4,6,8),返回8
我们经常说到脚本，什么是R脚本，就是如果需要运行一些命令，可以将命令写在一起，共同完成一个目标，这些代码叫做R的脚本，为扩展名.R的文件。
如果我们的脚本运行了一半，这时候我们需要关闭电脑，但是下次我想继续运行这次的设置和脚本，在输入q()退出后，选择y，则这个环境将以.Rdata的扩展名储存起来，下次我们双击就可以直接运行啦。简单说就相当于photoshop中的PS文件。
刚才介绍了Rgui的界面，但是这个界面不是那么美，绘图后如果调用出来图像就会影响界面展示，所以有很多集成开发环境出现，这其中最优秀的就是Rstudio，它的界面美观舒适，非常适合新手上路，即使在非常有经验的程序员也是广泛喜爱的。
下面我们就介绍Rstudio的下载安装，前提是我们的电脑已经安装好了R软件（见上一期.......超链接）
它也是免费软件，软件将R控制台，绘图窗口，帮助窗口集成到同一个界面下，并且支持代码高亮，自动补齐（非常好的一个功能）。
Rstudio软件的安装很容易，支持windows，mac，linux三个平台，这里我们只介绍windows平台的安装。
注意Rstudio只是R的集成开发环境，本身并无R软件，所以需要先安装好R软件。
Rstudio启动时会自动搜索系统中的R软件。
进入Rstudio官网https://www.rstudio.com/
选择download Rstudio
软件的安装跟wiodows系统其他软件的安装是一样的，下一步下一步……。安装之后双击桌面的Rstudio图标，进入界面
默认设置下有四个工作区，左上窗口用来打开脚本文件，左下窗口是R的控制台，右上窗口是环境和历史记录，右下有文件窗口，绘图窗口，帮助窗口等。
左上窗口，打开脚本区域，
如果我们想创建一个脚本，在左上窗口：file-new file-Rscript ，这样就在左上方创建了脚步文件，我们可以将要执行的代码在这里进行编辑。这样代码保存在一个脚本文件，我们就可以反复使用啦。
我们写一个最简单的代码看一下
在R中，<- 是赋值符号，比如，我们将1赋值给x，x<-1,
而不是用“=”，但是有时候“=”也有同样的作用。
<- 这个赋值符号我们太常用了，所以我们记住它的快捷键哈，Alt键+“-”，大家试试哦。
我们继续刚才写的代码哈
x <- 1
y<- 2
x+y 我们选择要运行的代码，然后点击run
显示3
R中是区分大小写的，R的计算速度蛮快的。
左下窗口是R的控制台
主要操作就在这里。
我们直接在这里输入代码，可以交互式的使用R，Rstudio非常强大，可以对函数自动补齐，比如我们想设置路径setwd()
这个时候按tab键自动补齐。
后面给出该函数具体来自于哪个包中。
下面看右上方板块，包括环境，历史记录
鼠标直接点击可以查看，比如我们用鼠标点击iris数据集，相当于view（）函数
在左上方会显示该数据集。左下方出现view（iris）命令。
左下方窗口包括：files，plots，packages，help和viewer
Files：显示工作区域内的文件
Plot：图形展示窗口，当我们在操作台绘图后，就会在plots界面展示该图形
例如，我们对cars数据绘图后，在plots界面就会展示图形界面
Packages：显示已经安装的软件包。点击包名字的超链接，会显示包的详细介绍，
Help：查看帮助文档，
但是大家有没有发现，我之前的图片背景是黑色的，而Rstudio默认背景是白色的。
默认是这个样子的，但是我们可以根据自己的审美标准设置一下，我设置后是这样滴。
当然，我相信你可能是一个非常有品位的R语言爱好者，那么我们下面就来学习界面设置，非常简单的。
在tools中点击global options选择apperance，出现这个界面就可以开始设置了，字体大小界面。
今天先到这里吧，我感觉就像我们给自己的家做装修一样，有了美丽豪宅，我们才能安心处理数据，发表SCI啊
那今天就到这里吧，等你的别墅装修完，明天我们继续！
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