我们的肠道不仅仅是消化吸收食物而已，肠道中的微生物菌群影响了我们生活中的方方面面，从我们的精神健康，睡眠，体重的增减或是对某种食物的偏好等等，肠道菌群仿佛是一只看不见的手，能改变我们的大脑。一直以来我们都知道情绪会影响肠道，但现在研究结果已经证实，其影响是双向的，肠道对大脑的影响是通过脑-肠轴来发挥作用的。脑-肠轴就是说大脑可以影响肠道，反过来肠道也可以影响大脑。
肠道是如何与大脑沟通的呢？
人体的“第二大脑” 肠道是如何与我们的大脑沟通交流的呢？首先我们来了解一下什么是脑-肠轴，脑-肠轴是神经系统与胃肠道之间在起源与功能上, 有较为密切的关系, 两者信息传递物质的产生、释放和作用等方面都具有一些共同点, 是通过中枢神经系统（centralnervous system, CNS）和多种肠神经系统（enteric nervous system, ENS）将大脑和肠道功能联系起来的双向应答系统。
我们的肠道中约有100万亿个微生物，这些寄居于我们肠道内并与我们共生的多种微生物群落，我们总称为肠道菌群。正常情况下肠道菌群与我们之间维持着复杂而微妙的动态平衡，微生物从宿主那里吸取养分为己所用, 宿主借助微生物来分解一些自身不能分解利用的物质。那么这些肠道菌群是如何传递信息的呢？前面说过肠道与中枢系统间有脑-肠轴这个通路，它使肠道传递与接收大脑的信号。目前国内外大量研究已表明, 肠道微生物与机体之间的平衡一旦被打破, 菌群就会从能量吸收、内毒素血症、短链脂肪酸、胆碱、胆汁酸代谢和脑肠轴等多种途径影响宿主的健康。
那么肠道菌群是如何影响我们情绪的呢？
肠道菌群可通过脑-肠轴影响宿主的脑行为，甚至心理状态，借助于神经递质、代谢产物、免疫信号、甚至基因表达等通过神经途径、内分泌途径、免疫途径等来与宿主的中枢神经系统进行交流。最近大量研究发现, 肠道菌群通过菌群−肠道−大脑轴与情感、认知密切相关。大脑中的一些神经递质如血清素 (5-羟色胺)、多巴胺等可以作用于大脑中的快乐中枢,引起愉悦。这些让人情绪愉快的激素，竟然有95%是在肠道里面合成的。如果肠道中合成这些化学物质的菌群较多，人的情绪就会比较丰沛，精神也比较愉快而且喜于社交。但是，如果肠道内这些菌群数目减少了，它们产生的这几种神经递质就会减少，情绪也会随之低迷，悲伤冷漠,自我封闭。肠道菌群可以影响宿主的情绪行为, 一旦肠道菌群的多样性被破坏, 就可能引起情绪行为的异常, 如焦虑障碍和抑郁障碍。中医学中虽然无“肠道微生态”“肠道菌群”名词，但其强调整体观念、阴阳平衡，这与微生态学认为肠道菌群平衡与人整个机体健康密切相关有相类似之处。
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