蛋白质组学数据库的下载

在做蛋白组学的实验过程中，数据库的下载是一个不能忽视的问题，数据库不匹配的话会对整个实验的结果造成很大的影响，那么如何下载数据库呢？

      我们通常用到的公共数据库有2个，一个是uniprot，应用十分广泛，另一个是NCBI。UniProt 是 Universal Protein的英文缩写，是信息最丰富、资源最广的蛋白质数据库， Swiss-Prot、 TrEMBL 和 PIR-PSD 三大数据库的数据而成。它的数据主要来自于基因组测序项目完成后，后续获得的蛋白质序列。它包含了大量来自文献的蛋白质的生物功能的信息，也是目前蛋白组学文章中使用最广泛的公共数据库。

以人（Homo sapiens）为例进行数据库下载。

Uniprot蛋白质组学数据库下载

1. 进入uniprot网站，点击Taxonomy。

   

2. 输入Homo sapiens，点击Search，弹出如下搜索信息。

   

3. 点击上图红框UniprotKB，弹出如下对话框，点击download，然后点击GO,即可下载该物种的数据库。

   

NCBI蛋白质组学数据库的下载

1. 进入NCBI首页，选择Taxonomy。

   

2. 输入Homo sapiens，点击Search，弹出如下搜索信息。

   

3. 点击Protein，弹出如下界面，点击RefSeq。

   

4. 点击 Send to,send to下拉菜单选file，fasta文件，TaxonomyID,然后create file，保存文件。

   

好了，今天就介绍到这里了。