http://lncrnamap.mbc.nctu.edu.tw/php/
该工具涵盖了lncRNAs信息介绍;可以下载lncRNAs序列;在肿瘤及正常样本中表达的数据(GEO数据);分析miRNAs结合信息
1、Browse列举了所有该工具收录的lncRNAs相关信息
点击查看大图
这里我们可以查看到对应lncRNA的Ensembl号;结合的miRNAs;cDNA序列;UCSC基因位置相关信息;差异表达;同源基因;干扰序列等
miRNA结合信息
lncRNA的cDNA序列
GEO数据展示lncRNA的表达差异(点击查看大图)
干扰序列及位点
2、通过相关信息查找需要的lncRNA
3、查看lncRNAs统计数据
4、下载相关信息及数据
lncRNA介绍
lncRNA序列
已经处理过的GEO数据,可查看在不同组织及肿瘤中的表达情况
如果想查找lncRNA序列、miRNAs结合位点以及在组织中的表达差异,快快试一下这个工具吧。
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