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段位晋升:课程知识清单

科研学习循序渐进,每一段位有所突破。学习至今,你又处于哪个段位呢?



今日酸谈学社停机更新系统,大家都看不了课。我建议一方面可以消化所学、反刍吸收,另一方面,也可以利用此机会整理知识的架构体系。


8月1号系统更新后,课程的排布也会做出一定调整,但总体逻辑一以贯之,未改分毫。借此,我想说明一下酸谈学社设置段位的目的,以及每一段位应该达到的科研能力水平。


第一段位:锻体凝精


课程从零基础开始入门,学习《三十六策》的1-8策,体验科研的模块化思维,认识五恒量三变量要素,并且对于变量的来源:筛和猜产生理解。


有变量恒量的动静参数概念,就能阅读文献拆解套路了。自三分以下的文献开始练习,从题目和摘要中提炼疾病、表型和变量类型,从材料方法中挖掘特定表型的对应实验方法。


这一段位,关键的成就是总结自己研究领域的恒量知识,对于常见的表型做哪些实验和检测什么指标烂熟于心。等到看了十来篇文献感觉数据格式非常相似的时候,进入下一阶段。


在锻体凝精段位,还配置了2篇经典的综述Hallmarks of cancer,了解肿瘤的十大经典表型。对一部分零基础学员而言,转换话语体系、领悟表型内涵是科研学习的第一道难关。肿瘤研究涉及的表型类型最广,几乎所有其他疾病牵扯的表型都能在肿瘤中找到镜像,因此,这两篇文献也可能成为各领域学员的普遍借鉴。


参透表型,熟悉模、法、标套路,就可以第一段位毕业。


第二段位:炼精筑气


进一步在逻辑思维上提升,本段位需要完成《三十六策》的9-15策的学习,洞察多元变量的组合规律。这一段位出现老谈的《二十四型》课程,对单一表型进行恒量套路的透彻解析。


因为《二十四型》内容非常细致,对于初学者来说还是有一定的知识记忆负担,我们可以先掌握大概,等具体用到时再按图索骥。如果老谈讲到的表型,正好是你要做的,那么别犹豫,全部背下来。


此段位还上一门新课《单元课》,针对专门的科研技能、数据库使用展开傻瓜式教学。手把手教是单元课的主旨,Oncomine是一门适合入门的单元课,考虑到Oncomine只收录肿瘤数据,其他研究方向的同学大致了解即可,不必深入。数据库使用很多时候有相通性,多尝试举一反三。


变量交互对应的是有机制的文献,这时候可以去看3-5的杂志,尤其是分子 通路类型的文章,体会多元变量论证的数据格式,归纳其中常见的实验手段。以文献验证《三十六策》所学,可为第一门套路课学习打好基础。


理解了变量间组合的逻辑,看得懂有分子机制的文章,就可以第二段位毕业。


第三段位:聚气生灵


《三十六策》完成了前15策的多元变量体系教学,应该对照文献案例检验规律了。第三段位上线的新课程《套路课》是针对一篇文献详细拆解的学社核心课程,由酸谈二侠联袂打造,教学员们完整的文献数据组织和复现方法。


配套的单元课对于临床相关性研究的三表一图经典数据、Prsim软件在数据统计和作图中的应用进行了重点教学,由此,学员能够动手实现数据输出的过程,获得里程碑式的成就感。


这一段位在《套路课》之后开始学习《文献一点通》的泛读技巧,《三十六策》是提纲挈领,文献泛读是逻辑方法的具体应用。在恒量变量基础上,对多元变量论证规律进行解剖和总结,能够在文献阅读中大大提升提取关键信息的效率。


掌握功能基因研究数据呈现的套路,会重新制作其中每个数据图表,并且将逻辑方法论应用于文献阅读,轻松识别论证链条,可算得上第三段位毕业。


第四段位:圆灵纳慧


功能基因即蛋白,是分子类型其中之一,换成了其他的分子类型,文章论证的基本规律依然会保持不变。此段位的聚焦点是《LncRNA套路课》,选取的文献案例从二元间接机制上升到了上下游都有的三元间接机制,依然是分子与通路的变量组合,所以与第一门套路课在数据格式上有许多共通之处。


经过2门套路课的洗礼,针对不同分子变量的分子 通路框架文章应当能够自行进行实操,这一水平可以跨越SCI 3分的档次,对于不少医学博士而言,已完全够用了。


这一段位配套的单元课,选择了KEGG数据库使用教程,既然要掌握以通路为机制的研究范例,KEGG这种通路分析利器必须要灵活应用。


lncRNA是一种新型的分子,机制研究颇有特点,经典的综述中将机制归纳为4种模型,我们也在这一段位中学习领悟。


突破分子 通路的二元或者三元间接机制套路,无论是功能基因还是lncRNA都能融会贯通,即可第四段位毕业。


至此,春季班宣告结束。

第五段位:积慧悟法


秋季班8月28日开课后更新,带来老谈的私房经验《SCI模块化写作》。数据会组织了,文章还不会写,就在此段位予以修炼,各位学员敬请期待。


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