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生物样本库发展趋势--文献综述

生物样本库BS小组


摘要:

生物样本库已经成为当今生命环境科学和生物技术领域研究必不可少的工具。这项研究利用Scopus数据库,在文献检索时在titlekeywords处使用一系列的biobank相关的检索词条,共分析了1939年至2014年间的20000篇文献,以期评估生物样本库的发展趋势。事实上自上世纪90年代以来,生物样本库领域在论文发表、期刊杂志和主题方向上一直保持超过平均的增长速度。我们发现,所有检索的生物样本库文献中约2/3是过去十年发表的,目前每年有1000篇以上的论文发表在600个不同的期刊。迄今为止大约有50000个作者在生物样本库领域做出贡献,平均每人发表1.5篇论文。然而这些作者的研究机构分布并不均等:接近90%来自欧洲、北美和亚洲,分别占比42%33%13%,而来自南美、澳大利亚和非洲的研究机构仅有5%4%2%。分析最常见的论文题目(期刊也一样)显示大多数研究关注血液样本,而其他生物样本类型,尤其是种子、细胞和组织的研究近年已呈逐渐增多趋势。在医疗应用中,输血占主导地位,其次是移植。自从2000年起,关于疾病尤其是健康的研究显著增加,而最近这十年队列研究和知情同意已成为高度相关的主题。在生物物种类型方面,关于人类的研究占主导地位,其次是病毒和植物(特别是种子样本的研究更有代表性)。基于学科分类的粗略估计表明,约1/3的论文集中于非人体的其他物种生物样本研究。然而,关于动物、真菌和微生物的生物样本研究数量仍不理想,尤其是在这些物种代表全球生物多样性方面仍显得不足。

编者按:总之,本研究数据来源于过去75年20000篇文献的调查分析,表明样本库从上世纪80年代末开始就呈现出明显的非线性增长趋势,在过去的10年增长尤为迅猛。随着人类生物样本库研究的增长,近年研究也已开始集中关注生物样本多样性,并且在生物样本和研究主题上跨学科间多样化也不断增长。这种增长总体来说令人看到本领域很好的发展前景,但仍要看到一个主要问题是研究地域分布不均性,这一点从作者研究机构分布看出来。问题是,如何解决这种南北地域研究的分化呢?这仅仅是一个科学政策的问题吗?还是个别措施比如样本库参与者就能改变的呢?此外,作为一个广泛意义的生物样本库如何能作为一个整体发展壮大,尤其在生物样本库网络协作范围内不断实现增长的目标,也是一个问题。ISBER,作为一个全球性的生物样本科学学会,在这方面将发挥关键作用。可以预期当前的生物样本库会持续增长,那么如何访问这些样本,如何将这庞大的数据资料集成?这也是我们必须面对的问题。每两年整合出版以及每年将题目收集整理出版,这样就够了吗?所收集到的数据能否足以支撑跨学科交叉应用?同时,如何确保对样本累积财富的持续经费支持?尤其是那些将作为遗产传递给下一代样本库人员和科学家们的样本。还有一个问题就是存储计划考虑到未来的危机情景了吗?幸好我们有最佳实践,作为重要组成部分,将有助于尽可能好地推动各种样本库计划顺利实施。有人可能认为没有必要编写或立即采用最佳实践,例如,用于某项研究的样本似乎本身较为独立,但走完整个样本库的流程后,众多样品采用统一标准,墨守成规,这种必要性就会或将会凸显出来。


作者:Astrin JJ, et al.
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