基因组分析发现急性淋巴细胞白血病（ALL）新亚型并找到潜在靶向治疗方法

资讯编号：ZX2016001015

题目：

基因组分析发现急性淋巴细胞白血病（ALL）新亚型并找到潜在靶向治疗方法

研究人员：

圣犹大儿童研究医院

发表时间：

2016.11.08

论文题目：

    《Genomic analysesidentify recurrent MEF2D fusions inacute lymphoblastic leukaemia》

期刊名称：

       《NatureCommunication》

癌症类型：

       急性淋巴细胞白血病（ALL）

癌症简介：

1、ALL是一种起源于淋巴细胞B系或T系细胞在体内异常增生的恶性肿瘤性疾病。

2、ALL的高发年龄为幼童（0~9岁）与高龄老人，且治愈率各有不同。

3、染色体重排在ALL中是一个重要的事件，且在不同年龄的患者中，重排结果不一样。

研究进展：

1、目前有30%的ALL病人的遗传基础不清楚。

2、B-ALL病人中，已经发现了一些染色体重排结果，但这些结果很少一部分能作为有效的治疗靶点。

研究手段：

       RNA-seq

研究样品：

       1724名ALL病人

分析要点：

1、先对560名ALL病人进行RNA-seq，发现到新的染色体重排结果，其中包括MEF2D-BCL9重排。

2、在1164名ALL病人中得到验证，然后通过对MEF2D重排的基因进行结构和功能特征的研究，发现了HDAC9与MEF2D重排的白血病细胞间的关系。

3、在小鼠身上进行存在有MEF2D重排的白血病细胞的异种移植，且在体外对得到的白血病细胞进行化疗药物治疗，发现这些细胞对HDAC抑制剂帕比司他（Panobinostat）敏感。

分析结果：

1、560名ALL病人RNA-seq结果：

（1）发现多个新的多发性重排靶标，其中包括MEF2D（22人），NUTM1，ZNF384。

（2）发现新的重排partner基因，其中新发现5个MEF2D fusion partner基因分别为：BCL9（16人），HNRNPUL1（3人），DAZAP1（1人），CSF1R（1人），SS18（1人）。

（3）最普遍的MEF2D重排是MEF2D-BCL9，其有4种亚型；MEF2D-HNRNPUL1只有一种亚型。

（4）MEF2D和BCL9都位于1q21.2-22，重排形式是interstitial insertion。

2、1164名ALL病人RNA-seq结果：

（1）发现31人有MEF2D重排，其中1人的MEF2D重排是和一个新的partner基因-FOXJ2发生的。

3、对MEF2D重排的基因结构和功能特征分析结果：

（1）MEF2D重排相比其他类型的重排，是一个later事件。

（2）发现MEF2D重排的白血病细胞会表达高水平的HDAC9。

4、对小鼠进行白血病细胞异种移植和体外化疗药物治疗后，发现帕比司他（Panobinostat）能够阻止该类细胞的增殖。

研究意义：

该研究发现了B-ALL一种新的亚型MEF2D重排，同时找到一种可能的靶向治疗方法。如果进一步的试验能够证明单独使用帕比司他或与其他治疗药物联合使用具有抗增殖活性，将为未来进行临床试验打下基础。

拓展阅读：

1、急性淋巴细胞白血病（ALL）：是因为体内淋巴细胞不正常增生造成的血液疾病，分为B细胞急性淋巴细胞白血病（B-ALL），T细胞急性淋巴细胞白血病（T-ALL）。

https://zh.wikipedia.org/wiki/%E6%80%A5%E6%80%A7%E6%B7%8B%E5%B7%B4%E6%80%A7%E7%99%BD%E8%A1%80%E7%97%85

2、文章原文：

http://www.nature.com/articles/ncomms13331