废话不多说，我们直接上文献：
1. Unravelling biology and shifting paradigms in cancer with single-cell sequencing.Nat Rev Cancer. 2017 Aug 24;17(9):557-569.
这篇去年8月份发表在Nat Rev Cancer杂志上的综述主要从单细胞测序在肿瘤研究中的应用来展开，综述了单细胞测序的技术、在研究肿瘤异质性和基因组进化中的作用，并以肺癌为例说明了单细胞测序的应用场景：
Single-cell sequencing for the decomposition of heterogeneous cellular populations and the analysis of rare cells in lung cancer
Single-cell sequencing can be leveraged to study cancer
genetics and biology at all stages of disease development.
2. Single-cell RNA sequencing for the study of development, physiology and disease.Nat Rev Nephrol. 2018 May 22. doi: 10.1038/s41581-018-0021-7.
今年5月22号发表在Nat Rev Nephrol杂志上的综述，主题是单细胞RNA测序在发育、生理和疾病研究中的应用，本文介绍了单细胞测序技术的流程、不同单细胞捕获方法、数据分析流程和软件，以及应用等等。
general strategy for scrNA-seq
Microdroplet-based scrNA-seq
Creation of a single-cell-resolution virtual organ.
Use of cluster and subcluster methodology to define cell subtypes
3. Single-cell RNA sequencing to explore immune cell heterogeneity.Nat Rev Immunol. 2018 Jan;18(1):35-45. doi: 10.1038/nri.2017.76. Epub 2017 Aug 7.
这篇今年的Nat Rev Immunol杂志上的文章我们以前介绍过，主题是通过单细胞RNA测序研究免疫细胞的异质性，具体来说不仅包括了技术：
还有不同的应用场景：
Single-cell profiling uncovers distinct cell subsets in disease
Characterizing heterogeneity within one immune cell population using scRNA-seq
4. Single-Cell RNA Sequencing: Unraveling the Brain One Cell at a Time.Trends Mol Med. 2017 Jun;23(6):563-576. doi: 10.1016/j.molmed.2017.04.006. Epub 2017 May 10.
去年Trends Mol Med杂志上关于单细胞RNA测序研究脑及神经系统疾病的综述，除了介绍单细胞测序的不同技术平台外，还探讨了在研究神经退行性疾病中的应用。
Single-cell Sequencing Data Analysis Workflow
5. Single-Cell Transcriptomics Meets Lineage Tracing.Cell Stem Cell. 2018 May 3. pii: S1934-5909(18)30176-0. doi: 10.1016/j.stem.2018.04.014.
这篇综述的侧重点在单细胞测序用于细胞谱系（lineage）追踪，内容包括了不同的算法、策略等等：
Overview of Lineage Reconstruction Algorithms
Overview of Genetic Lineage Tracing Strategies
6. Single-Cell Genomics: Approaches and Utility in Immunology.Trends Immunol. 2017 Feb;38(2):140-149. doi: 10.1016/j.it.2016.12.001.
这篇是介绍单细胞基因组学在免疫领域的研究，其中数据分析部分说的比较细，对分析感兴趣的同学可以多看看。
7. Single-cell transcriptomics to explore the immune system in health and disease.Science. 2017 Oct 6;358(6359):58-63.
这篇Science综述也是从免疫角度来说的，比较简短。
Inferring cellular trajectories from single-cell data
8. The trajectory of microbial single-cell sequencing.Nat Methods. 2017 Oct 31;14(11):1045-1054. doi: 10.1038/nmeth.4469.
这篇nature methods是从微生物单细胞测序的角度来介绍的，
Timeline of scientific milestones in single-cell microbial sequencing.
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备注：入群学习
从以下20个热点入手，每天给大家分享干货：
1 | miRNA非经典机制 | 11 | 肠道菌群 |
2 | lncRNA的10种机制 | 12 | 细胞自噬 |
3 | circRNA | 13 | 细胞焦亡、铁死亡 |
4 | 单细胞测序 | 14 | 间充质干细胞 |
5 | 转录因子 | 15 | 肿瘤干细胞 |
6 | 可变剪接 | 16 | 外泌体 |
7 | SNP | 17 | 氧化应激 |
8 | 泛素化修饰 | 18 | 调节性T细胞 |
9 | 组蛋白修饰 | 19 | RNA甲基化修饰 |
10 | 蛋白激酶和磷酸酶 | 20 | 肿瘤微环境 |
而这些研究方向参与疾病发生发展过程的分子机制，可以归纳总结为一下几类研究：
①分子（DNA、RNA、蛋白质、小分子）的表观遗传修饰；
②分子拷贝数的表达变化差异；
③RNA分子的剪接加工、出核、细胞组织水平的时空变化研究；
④特殊的一群细胞类型研究、细胞通讯微环境研究；
⑤具有临床应用潜力的新技术（CRIPSR）或者载体（膜结构、细胞等）；
⑥关注细胞生理学现象：自噬、凋亡、线粒体失功等；
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