一、研究背景

Bioconductor中Pathview是一个基于通路的数据的集成和可视化的R包。该软件分为四个功能模块：下载器，分析器，映射器和查看器。Pathview能够将用户的数据映射和渲染到相关的通路图形中。

只需要输入KEGG通路ID与要查询的基因的logFC，最后就能生成经过定制渲染过的高清KEGG通路图。

二、分析流程展示

三、示例结果

Fig2. KEGG pathway图

Fig3. 展示基因变化的通路图

Fig4. 经过渲染的通路图

为大家安利一个数据挖掘精品课程，有着十年生物信息分析经验的宋老师，擅长高通量数据分析、项目开发与设计，拥有丰富的线下和线上培训经验。还构建了自助生物信息学分析平台：云生信“www.biocloudservice.com”。

基于生物信息学挖掘高通量（二代测序/基因芯片）数据的关键靶标基因

课程简介

本课程是生信基础班，目的是让临床医生、动植物学研究者了解生信的优势、与自己学科的密切关联，并且学会基于生信的分析思路和实际工具、软件的操作。

学习目标

学会原始芯片/测序数据的查找下载、差异分析、KEGG pathway富集分析、GO富集分析、聚类热图heatmap图制作、蛋白互作关系预测等。

适合人群

对生物信息感兴趣的无基础或者基础较差的学员。

互作网络图

报名方式

扫描下方二维码，付费报名。

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