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师兄,我的细胞株怎么怪怪的

实验室细胞房内,小师弟正一筹莫展,最近实验总出问题,养出来的细胞怪怪的,实验结果总是重复不了,浪费了好多时间,眼看研究生涯即将过半,心急如焚。



向师兄请教,师兄经过仔细检查,发现小师弟的细胞株居然被污染了……


作为细胞老司机,师兄开始进行仔细的指导(唐僧式念经)


首先,让我们来看看细胞株错误鉴定

在1950年代早期,Johns Hopkins的科学家们使用源于癌症患者的宫颈上皮细胞(HeLa)发表了第一个人类细胞细胞株。此后的几年,人们发现有力的细胞系可以污染和过度生长缓慢生长培养物。尽管有这样的早期发现,细胞系交叉污染已经扩散成为生物医学科学中普遍关注的问题,并持续了60多年。HeLa细胞作为研究工具的有用性,及其永生性和活力,使其在一定时期内分销至全球,而细胞培养者对可能发生的交叉污染并未察觉,尤其是在缺乏良好的细胞培养实践时。


据估计,现在使用的细胞株大约有15-20%或许已经不是人们认为的细胞。2004年的一篇报告指出生命科学领域在细胞来源和细胞株身份鉴定检测方面普遍缺乏警惕。在440名受访者中,超过三分之一的人从其他实验室获取细胞株,且几乎半数没有进行身份检测。幸运的是,已建立的细胞收集在细胞系识别问题上变得更加积极主动。比如,欧洲认证细胞收藏中心(ECACC)在英国公共健康网站上列出了被错误鉴定细胞株的完整名单。




那如何确定细胞系的完整性和身份呢?

核型分析、同工酶分析和DNA条码技术是检测种间交叉污染的宝贵工具,短串联重复序列(STR)分析已经成为人类细胞系种内身份检测的标准。Alec Jeffreys爵士在1980年代开发了法医DNA指纹图谱技术,最初用于鉴定实验的southern杂交已被基于多重PCR、同时扩增基因组中多态STR位点的技术所取代。


每个等位基因以特定的频率出现在种群内,通过扩增足够数量的不同等位基因,乘以每个等位基因在此种群内的频率,就可获得一个细胞系的独特档案。




细胞株储存和认证服务

细胞培养收集中心开始建立亲密关系解决错误识别的问题,并正在共同努力发布一个人类细胞系身份验证的标准(ASN-0002)。该标准使用SRT分型和免费的包含近2700个人类细胞系STR档案的在线交互数据库,让使用者可将自己的STR数据与数据库进行比较。该数据库通过提供最接近的匹配结果,帮助识别细胞系,或者对新细胞系的独特性给予信心。


有人提议细胞系认证应该成为提供基金和研发成果发表的条件。尽管认证还没有成为所有基金和出版物的必要条件,但许多期刊已经采用细胞系的认证政策。而且过去几年内,对ECACC认证服务的需求显著增加。偶尔,出于期刊提供细胞系身份证据的要求,在项目完成后会提交样品,有时会出现不知情使用错误的细胞系导致文章无法发表。发表论文要求,更重要的是生命科学团体增强再现性的愿望,强调了所有科研人员需要对采购、维持、细胞系所得结果验证而负责。




实验室中引起细胞系交叉污染的常见原因及预防措施

除了考虑识别方法的重大技术进步和常规检查需要,更重要的是使用细胞系的实验室应坚持遵循良好的操作实践,使细胞株错误识别问题最小化。




实验室中良好的细胞保存实践

从冷冻储存复苏后不久鉴别出非预期的形态或生长特征可能意味着冻存时错误标记了冻存管,或者甚至是从储存库拿错了冻存管。实验室里每个可以进入细胞库的成员都必须维护冻存库中细胞的准确记录。

 

黏贴不当的标签会脱落,导致库里出现没有标签的冻存管,因此要将信息(包括正确、通用格式的细胞系名称)打印至适合低温储存的标签上。或者,直接使用兼容极低温度条件的实验室记号笔清晰标注冻存管。

 

定期清洗和消毒细胞培养室的共享解冻设备将有助于确保细胞系的完整性。

 

维持对细胞储存物的信任和确保细胞系相关数据被同行审查接受,必须使常规身份检测和谨慎的良好细胞培养实践相结合。遵循这些最佳实践将有助于防止浪费时间和无效研究。




参考文献:

1.Freshney IR. Culture of Animal cells: A Manual of Basic Technique and Specialized Applications, 6th ed. Hoboken

2.Horbach SPJM, Halffman W. The ghosts of HeLa: How cell line misidentification contaminates the scientific literature. PLOS One. 2017 Oct; 12(10) e0186281.

3.Nardone RM. Eradication of cross-contaminated cell lines: A call for action. Cell Biol Toxicol. 2007; 23: 367-72.

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