菌群移植问题1：菌群到底是手工提取好还是仪器提取好？

现在肠道菌群提取的方法有两种：一种手工提取，一种使用仪器进行提取。那到底哪一种方法值得在临床上推广呢？且看下面这篇迄今为止最大规模的克罗恩病的实施结果。

菌群移植(HMT)治疗克罗恩病的长期安全性

克罗恩病（Crohn's disease,CD）发病机制复杂，而且对患者生活影响极大，除了腹痛、腹泻、血便等不适，严重的患者可能会合并肠瘘、肛瘘，更为严重者可能会癌变。有研究发现，CD患者肠道内的细菌种类与数量（菌谱）和正常人相比存在显著差异，菌群移植（HMT）已被作为CD的一种潜在治疗选择。然而，HMT治疗CD患者的安全性和有效性的大样本证据仍然缺乏。近日，国内的临床团队发表了一项迄今为止样本量最大的HMT治疗CD的长期随访研究数据。

此研究的目的是为了长期评估不良反应（AE）的危险因素和评估HMT对CD患者的疗效。

从2012年10月到2016年12月，南京医科大学附属第二医院实施了这项单中心研究（NCT01793831），对轻度到重度CD患者进行经中肠途径的HMT治疗。研究共纳入139名CD患者，一共进行184次HMT治疗，患者信息见下表。HMT后分别随访1-5年时间，记录HMT不同制备方法的临床缓解率、反应率以及不良反应发生率。

HMT后一周内出现总不良反应的概率是13.6%（25/139），包括腹泻、发热、腹痛、胀气、便血、呕吐、腹胀和带状疱疹，未发生严重不良反应。84%（21/25）的不良反应都可自行缓解，无需治疗。HMT治疗超过1个月后，没有观察到其他不良反应发生，因此建议采用1个月来定义HMT的短期和长期不良反应。

在发生不良反应可能的危险因素中，只有肠菌的提取制备方法与不良反应的发生率密切相关。手工提取制备肠菌进行HMT，不良反应发生率为21.7%（15/69），明显高于自动化提取制备的不良反应发生率8.7%（10/115）。

手工提取或自动化提取制备肠菌的方法不会影响HMT治疗CD的疗效。另外该研究还发现，发生不良反应的患者临床反应率（45%，9/20）和缓解率（20%，4/20）低于未发生不良反应的患者的反应率（75.6%，90/119）和缓解率（63%，75/119）。

本队列研究纳入了大样本量的CD患者进行HMT，并保持了1-5年的随访，证明改良后自动化菌群提取制备方法能降低不良反应发生率，但并不影响CD患者的临床疗效。

综上所述，该研究结果表明手工提取与使用仪器提取在治疗克罗恩病时无明显疗效差异。但是手工提取会显著提高移植后的不良反应率。

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