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S03E03.TCGA数据库操作及拷贝数变异数据分析

BI


TCGA

The Cancer Genome Atlas (TCGA) 肿瘤基因组图谱(TCGA)计划,由美国the National Cancer Institute (NCI) and the National Human Genome Research Institute (NHGRI) 合作发起的。它为33种癌症的关键基因组变化生成了全面的多维图谱。



TCGA数据集,描述肿瘤组织和来自超过11,000名患者的匹配正常组织的2.5PB数据,是公开可用的,并且已被研究界广泛使用。这些数据为独立研究人员和TCGA研究网络出版物的一千多项癌症研究做出了贡献。


网址:https://cancergenome.nih.gov/ 


讲师介绍:张丽梅

上海其明信息技术有限公司

产品经理

主要负责临床生信功能的技术支持


演讲主题:TCGA数据库操作及拷贝数变异数据分析

内容摘要:

TCGA数据库介绍

TCGA数据库操作

TCGA应用举例


本期课程主要对TCGA数据库进行了介绍,并详细介绍了TCGA数据库的下载及操作;最后以拷贝数分析为例对TCGA乳腺癌拷贝数变异数据进行分析,以获得高风险的拷贝数变化区域和基因。大家可以点击下方视频观看完整的课程!



哈哈

数据库系列

第三讲视频

1


GCBI出品



看过视频教程并对此次课程中演示的链接和课程课件资料有需要的小伙伴可以留言,小编会将内容整理后发送给你。


下期课程—“Clinvar数据库介绍及使用”,我们下周二见!

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