2018年12月1-4日第60届美国血液学年会(ASH)暨博览会在美国加州圣迭戈举行。每年的美国血液学年会是全世界血液学研究者的盛会。年会上公布和发表世界各国的最新血液学的研究进展。本次会议中的一些研究强调了微滴式数字PCR(ddPCR)灵敏度高和准确性高的特点,对微小残留病(MRD)的量化是一个强有力的工具,以下摘选了几个报告的重点内容:
01
ddPCR应用于治疗TP53突变的MDS和AML的1b期临床试验
佛罗里达州Moffitt肿瘤研究中心的血液肿瘤学家David Sallman博士介绍了一项临床试验的结果。Sallman博士及其团队研究了阿扎胞苷(一种化疗药物)与小分子药物APR-246的联合用于治疗具有TP53突变的骨髓增生异常综合征(MDS)和急性髓性白血病(AML)的患者。前期数据已经表明,单独使用阿扎胞苷可使20-30%的TP53突变的MDS和AML患者完全缓解。当加入小分子药物APR-246后,这些患者的完全缓解率达到了82%,这比单独使用阿扎胞苷具有更显著的疗效。研究人员使用NGS与ddPCR的方法量化MRD来分析缓解深度。Sallman博士说到“在我们的试验中,我们发现ddPCR在定量患者特异性缓解深度方面具有显著的效果”。
Sallman博士指出,该临床试验的第2阶段将继续使用ddPCR作为确定缓解深度的方法之一,也将会用于阿扎胞苷与APR-246联合治疗患者的预后评估。
02
ddPCR有助于预测AML患者的缓解
同种异体造血干细胞移植(HSCT)是AML等血液系统恶性肿瘤的治愈方法之一。但是在移植后,许多患者会出现复发。科罗拉多大学和科罗拉多儿童医学的Amanda Winters博士和她团队利用ddPCR检测MRD以预测哪些患者可能在HSCT后会产生复发。虽然先前的实验已经证实MRD对化疗后的患者复发具有高度预测性,但很少有研究评估MRD在患者HSCT后复发的预测能力。
该团队使用ddPCR跟踪检测36名患者的21种AML相关突变,36名患者均接受了骨髓移植并同意组织样本库协议,在诊断时至少被检出具有21个突变中的一个。研究发现,基于ddPCR的MRD评估可预测AML患者HSCT后的复发和存活。移植后1个月时,MRD的存在与复发率和死亡率显著相关。基于这些发现,Winters博士和她的团队认为骨髓移植后利用ddPCR检测AML的相关突变可以帮助医生更早地发现疾病的复发。
03
ddPCR定量MLL融合转录本监测MLL-r AML的MRD
目前实时定量PCR(RQ-PCR)是MLL重排(MLL-r)白血病患者MRD监测的标准方法。然而,当只存在少量白血病细胞时,这种方法就显得不够精确了。来自澳大利亚昆士兰大学的Sadia Afrin博士及其团队评估了使用ddPCR定量MLL融合转录水平是否可以提高MLL-r白血病患者MRD检测的灵敏度。
首先对44名MLL-r AML与ALL患者进行测序,确定每个患者特异性的融合序列,然后设计对应的融合检测探针用ddPCR进行MRD的评估,样本同时采用RQ-PCR的方法进行平行检测。将ddPCR与RQ-PCR检测的结果进行比较,遵循EuroMRD的指南。
结果显示ddPCR法表现出更高的检测灵敏度与可靠性,其中4个低于EuroMRD指南RQ-PCR检出阴性的样本均可用ddPCR检出,显示出ddPCR比标准的RQ-PCR法可提供更稳定且更高灵敏度的MRD分析结果。
Afrin博士认为ddPCR是一种很有前景的技术,可以准确、灵敏地定量MLL融合转录本,监测MLL-r白血病的MRD。ddPCR的高灵敏度和高稳定性可以改善基于反应的治疗分层以及预测复发。
参考文献:
1. Sallman, David A., et al. 'Phase 1b/2 Combination Study of APR-246 and Azacitidine (AZA) in Patients with TP53 mutant Myelodysplastic Syndromes (MDS) and Acute Myeloid Leukemia (AML).' (2018): 3091-3091.
2. Winters, Amanda, et al. 'Tracking of AML-Associated Mutations Via Droplet Digital PCR Is Predictive of Outcomes Post-Transplant.' (2018): 2138-2138.
3. Afrin, Sadia, et al. 'Quantitative Analysis of MLL Fusion Transcripts By Droplet Digital PCR to Monitor Minimal Residual Disease in MLL-Rearranged Acute Myeloid Leukemia.' (2018): 2746-2746.
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