基于基因热点突变检测的NGS小panel已经获得临床广泛认可（如2018年9月经NMPA批准上市的世和肺癌NGS多基因检测试剂盒——益胜康）。除了热点基因检测之外，是否可以通过将panel扩大到数百个基因的全外显子测序来挖掘更多有临床指导意义测序结果，从而更好地改善患者预后，这也是目前临床对NGS大panel检测价值的思考与探究。近日，针对这一主题，MD安德森癌症中心的研究者们发表在JCO Precision Oncology的一篇前瞻性研究给出了肯定的答案。
该研究前瞻性入组675例患者，这些患者均已进行46或50基因的NGS小panel测序。其中569例完成了409基因NGS大panel测序。最终，521例患者接受了至少6个月随访或在6个月内死亡，这一部分患者被纳入后续分析。此外，该研究纳入了多种癌症类型的患者，包括肺癌、结直肠癌、肉瘤、乳腺癌、卵巢癌和膀胱癌等实体肿瘤。值得一提的是，研究中采用的NGS大panel覆盖了409个基因的全外显子，而不仅仅只是部分常见突变位点。
研究结果显示，在521例患者中，71%的患者没有在NGS小panel测序中发现任何可指导治疗的基因突变。而这521例接受409基因NGS大panel检测的患者，214例（41%）至少有一个具有临床意义的基因突变，NGS小panel却检测不到这些基因突变。
图1 NGS大PANEL可检测到的所有患者基因突变汇总
这214例仅由NGS大panel检测出具有临床意义基因突变的患者中，有40例（19%）接受了后续相应匹配的靶向治疗方案，另外108例患者则接受了不匹配基因突变的治疗方案（不使用匹配治疗方案的原因包括患者身体状况不佳，希望寻求离家更近治疗，以及肿瘤医生认为该基因突变在临床上不可行或靶向治疗在特定肿瘤类型中证据不充分等等）。
分析患者预后发现，与接受了不匹配基因突变的治疗的患者相比，匹配治疗方案患者的总生存率显著提高（P=0.017），与剩余其它队列的患者相比，同样显示出最优的生存获益。
图2 NGS大panel检测后匹配相应治疗方案的患者总生存率显著提高
该研究的结果表明了NGS大panel测序较小panel能让更多肿瘤患者获益，与恰当的临床治疗相结合，能很好地体现其临床价值。当然，不同的肿瘤类型其有临床意义的基因（actionable gene）有较大差异，而且这些基因变异匹配的临床治疗也不尽相同。接下来关键的步骤就是要借助公共数据库和大数据的力量来不断鉴定出针对各瘤种的actionable gene 并根据最新临床研究的结论匹配最合适的治疗方案。
世和1号®是世和基因于2013年正式推出的全景癌症基因检测项目，是国内首款泛实体肿瘤的大panel高通量测序（NGS）产品。与上文研究中的测序panel类似，世和1号®大panel测序范围完整覆盖425个肿瘤相关基因的全部外显子，而不仅仅只是部分常见突变位点，这归功于由世和基因100%自主设计、获得7项相关发明专利的癌症基因靶向富集探针。
此外，世和1号®大panel测序范围还包括融合相关的重要内含子区域、可变剪切区域共约1.28Mb个碱基位点，检测结果包含覆盖范围内的所有突变类型（点突变、插入缺失突变、拷贝数变异以及融合突变），从而有机结合常见和罕见驱动基因突变，同时提供错配修复(MMR)相关基因状态、MS分析和肿瘤突变负荷（TMB）等信息，最大化临床获益。
世和1号®选取的425个基因包括NCCN指南FDA用药指南基因、驱动基因家族成员基因、多条癌症驱动通路重要节点基因、免疫治疗疗效相关基因等多类别关键基因，一次展现肿瘤基因突变全景，辅助临床在第一时间制定个体化治疗方案，覆盖靶向治疗、免疫治疗、遗传风险、化疗用药，提示全方面的检测信息！
Scott Kopetz, et al. JCO Precision Oncology. 2019. DOI https://doi.org/10. 1200/PO.18.00213
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