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张洪亮教授:液体活检在肿瘤全程管理中的应用

十年间肺癌治疗经历了翻天覆地的变化,已经由病理分期指导下的放化疗到以驱动基因为指导的靶向治疗。从2004年开始,EGFR靶点突变的发现,拉开了非小细胞肺癌靶向治疗的序幕,随后ALK、ROS1等靶点的发现及应用促使靶向治疗蓬勃发展。2012年,首次发现Nivo单抗可使NSCLC患者从中获益,现在免疫治疗已经成为肿瘤治疗最具希望的治疗方式,肿瘤成为慢性病已现曙光。

受肿瘤本身的特点和目前的临床诊疗限制,肺癌中70%患者初诊即为晚期,无法获得足够的组织用于检测。在治疗过程中,由于肿瘤的时空异质性问题,需要多次检测匹配精准治疗。此外,目前临床通过影像学和/或肿标进行肿瘤监测/疗评,除了存在灵敏度和特异性不足的问题,还无法得知疾病进展原因。而基于外周血的液体活检,具有独特优势,可以辅助解决这些临床困境。

cfDNA是血液中细胞成分之外的小片段DNA,由细胞凋亡或坏死后释放入血的,肿瘤所释放的DNA称为循环肿瘤DNA(ctDNA,circulating tumor DNA),因此,ctDNA是cfDNA的一部分,ctDNA的含量占比与肿瘤负荷相关,被形象的比喻为“分子CT”。除了代替组织样本检测和评效之外,液体活检ctDNA在肿瘤早筛、疾病分型、治疗决策、疗效监测、肿瘤异质性分析、耐药分析等方面都有研究应用探索。目前液体活检在临床肿瘤的应用方向及进展有以下几点:靶点检测,预测靶向药物疗效,计算肿瘤突变负荷(TMB),预测PD-1/L1抑制剂疗效,监测分子肿瘤负荷,克隆进化分析等。

靶点检测,预测靶向药物疗效

目前有多个基因检测的平台并有多种方法可以选择,这些平台各自的优势特点如下:DHPLC方法对晚期NSCLC患者行EGFR基因突变检测,灵敏度3%,该检测方法获得欧盟认证;ARMS检测因检测灵敏度高、仪器设备要求低、操作流程及数据分析简单,目前为临床广泛采用的检测技术,且CSCO肺癌诊疗指南作为1类证据推荐采用ARMS方法行EGFR基因突变检测,2014年以后将检测技术更换为灵敏度相对高的ARMS法;微滴数字PCR技术,其灵敏度相对更高,目前仅用于科研;二代测序技术可实现多基因平行检测,检测灵敏度由测序深度决定,既往文献报道当测序深度达1*10^4时,其EGFR基因突变检测灵敏度0.2%。目前,常用的平台为CSCO指南推荐的ARMS检测或数字PCR检测,特别是随着NGS检测技术的兴起和发展,NCCN、CSCO指南也建议临床也选择NGSpanel检测,血浆检测检出限低,组织和血浆检测一致性高,一次检测多基因以筛选更多获益患者。

BENEFIT研究提示血浆ctDNA检测可精准指导靶向治疗,使用多基因NGS检测发现,若除了EGFR突变,同时伴随存在驱动或抑癌基因突变检出,会导致TKI获益时间缩短,提示治疗疗效不佳。在治疗过程中,EGFR敏感突变的存在与否也可以可提示治疗的预后。ADELOS研究对比了4种血浆ctDNA检测T790M的平台,以cobas组织检测作为参照,NGS血浆T790M检测显示出较最高的敏感性和一致性。NGS检测指导精准治疗,疗效分析结果显示,ctDNA液体活检在靶点检测,预测药物疗效方面具有临床指导价值。

计算肿瘤突变负荷(TMB),预测PD-1/L1抑制剂疗效

随着免疫治疗的兴起为肿瘤患者带来新的希望,但是总体治疗总体有效率低的问题困扰着临床。目前对于免疫治疗疗效预测也是临床上急切需要的指标。多个癌种的综合研究发现TMB跟免疫疗效成正比,TMB一般以肿瘤非同义突变总数量或每1Mb(1兆碱基)的突变数量来表示。虽然,从突变到产生新抗原,每一步都有很大折损,但理论上:TMB越高,最后能够被T细胞识别的新抗原产生也越多,对PD-1/PD-L1抑制剂可能更敏感。在临床上,不经过筛选,确实也看到了NSCLC一部分患者对PD-1/PD-L1抑制剂有效;而肿瘤TMB<1/Mb,几乎不太可能产生新抗原(occasionally),对PD-1/PD-L1抑制剂不敏感。基于肿瘤组织的肿瘤突变负荷(TMB)已被论证与恶性黑色素瘤、非小细胞肺癌、尿路上皮癌等多个实体瘤的免疫检查点抑制剂(ICB)单药疗效正相关。然而,有很多患者没有足够的肿瘤组织可供使用,因此针对基于血液的TMB(bTMB)疗效预测的方法有待展开探索尽管目前未确定TMB值一致地cut-off值。但研究者探索了多个cut-off值,发现无论10、16还是20,都可以看到PFS和OS的获益。且bTMB≥16且PD-L1表达>50%的患者从Atezolizumab的治疗中获益更最多。在bTMB≥16的人群中,PFS HR为0.57(95%CI: 0.33~0.99),实验组与对照组中位PFS分别为4.2个月和2.9个月,HR为0.57(95%CI:0.33~0.99),中位OS分别为13.0个月和7.4个月。由于bTMB≥16组观察到了更优的PFS获益,最终选择了16为cut-off值。进一步扩大患者人群验证也得到同样的结论。在bTMB≥16人群中,研究观察到了PFS和OS的显著获益,PFS HR为0.65(95%CI:0.47~0.92),OS HR为0.64(95%CI:0.44~0.92),进一步确定了16是bTMB预测Atezolizumab疗效合适的cut-off值。

在2019年NCCN指南中建议进行TMB检测,筛选免疫治疗获益患者。但是,其评估标准还无共识。2019年BMJ一篇review综述中讨论了TMB检测在临床实践中需要考虑的因素,提出目前的建议包括样本类型,是组织样本较多;基因panel覆盖区域应大于0.8 MB(最好大于1 MB)确保报告TMB的信息;TMB计算的需一致性分析,检测panel需与WES/FDA批准的panel的进行一致性分析比较;而cut-off 划分目前无标准等,需要与疗效数据关联确定。在中国人检测数据中可以看出,在不同癌种、不同分期,TMB分布不同,基于bTMB可有效预测免疫检查点抑制剂疗效,表现出良好的阳性预测值和阴性预测值,特别在疗效数据中,直观的看到TMB -H患者ORR高,而TMB-L患者不能获益。

监测分子肿瘤负荷

已有研究表明,ctDNA水平与肿瘤分期、肿瘤体积大小、转移灶个数及治疗都有关,可以反映肿瘤负荷,即“分子CT”。在肝癌的一项研究中发现,肿瘤大小与ctDNA和肿标相比,相关性更强。

ctDNA 提示肿瘤预后:在肺癌中发现,高ctDNA水平与预后差相关,转移性结直肠癌中也是如此,并且比肿标有更高的灵敏性。

ctDNA可评估术后微小残留病灶(MRD):一项I~III期40名患者肺癌和54名健康成人的40名患者的255个样本。在94%经历复发的可评估患者中,ctDNA在第一次治疗后血液样本中被检测到,表明可靠地鉴定了MRD。治疗后ctDNA检测,在72%的患者中进行放射学检查,中位数为5.2个月,53%的患者携带与酪氨酸激酶抑制剂或免疫检查点阻滞有利反应相关的ctDNA突变谱可从靶向治疗和免疫治疗中获益。活检液体可以准确地检测肺癌患者的ctDNAMRD,同时为患者提供个性化治疗参考。

术后ctDNA监测肿瘤复发风险:55位女性早期乳腺癌患者,新辅助治疗后手术,监测术后ctDNA的有无评估肿瘤复发风险,发现术后ctDNA与肿瘤复发风险高度相关。

ctDNA与肿瘤疗效和复发相关:93%肺癌患者在监测过程中出现ctDNA阳性(2个以上SNV)其中3名患者,辅助化疗前后,血浆检出SNV数目上升,且3名患者均在术后一年出现了复发,提示ctDNA 分析能够反映辅助化疗耐药。患者术前50天进行PET检测,没有发现脑部病灶;术后血浆中有ctDNA检出;术后54天,临床确诊脑部转移,无其他病灶。该结果提示ctDNA较影像学更灵敏,可能更早提示复发。

ctDNA可监测免疫治疗效果:使用durvalumab治疗的肺癌患者研究显示,用药后6周ctDNA水平降低的患者肿瘤体积变小、治疗获益时间长,提示ctDNA水平与免疫治疗疗效相关。

克隆进化分析

不同癌种,在不同的发展阶段,肿瘤会具有癌种特异和阶段特异的驱动突变,但不同癌种间也存在共同的驱动事件。BENEFIT研究显示:吉非替尼治疗开始后,第8周EGFR突变消失的患者预后好,动态监测EGFR突变有助于预测预后。血浆出现获得性T790M 突变的中位时间为7.6月(95%CI:6.0~10.0)。从T790M阳性至疾病进展的中位时间为2.0月 (95%CI:2.0~4.9)。但是临床该何时更改治疗方案,一项apple研究对比了吉非替尼治疗EGFR阳性患者分别在影像学和ctDNA提示PD时,更换治疗方案,比较获益时间,目前该研究还在进行中,期待结果。

总之,液体活检目前的主要应用是: 靶点检测,预测靶向药物疗效,ctDNA液体活检特异性好,灵敏度高,有临床价值;计算肿瘤突变负荷(TMB),预测PD-1/L1抑制剂疗效,极具前景,cut off需明确;监测分子肿瘤负荷,ctDNA可评估肿瘤预后、微小残留病灶MRD和复发;克隆进化分析,可以协助临床较早期发现耐药原因。

张洪亮 教授

新疆自治区中医医院肿瘤二科主任,主任医师 、副教授、博士生导师,二级主任医师,兼任新疆医科大学中医学院中西医结合内科教研室主任;新疆自治区中医医院国家药物临床试验机构(GCP)肿瘤学负责人;中国中西医结合学会肿瘤专业委员会副主任委员;中国临床肿瘤学会(CSCO)理事;中华中医药学会肿瘤专业委员会常委;新疆中西医结合学会理事、副秘书长、侯任秘书长;《新疆中医药》杂志编委等。主要从事中西医结合肿瘤防治工作,擅长肺癌、乳腺癌、胃癌等治疗,发表论文百余篇,SCI 6篇,出版专著3部,参编1部

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