师兄师姐一直说的什么KEGG分析,
你是不是也只能假装听得懂的样子,但到底为啥要做KEGG分析,还是不明白……KEGG Pathway分析就是信号通路的分析咯。
用处么,给你举个简单的例子。这么冷的天,就讲电暖气呗。两个电暖气,你要知道其中某个原件是干嘛用的。那就把那个原件拆掉,然后比对一下拆掉和没拆掉的暖气有啥区别。比如去掉原件后,突然没法升温到20°C了。那这个基因肯定是调控升控温这个通路的。换在实验上也一样。比如使用某基因突变或者敲减和野生型作为对比,做的芯片。
那突变后,就会导致这个基因下游的基因产生表达变化,这些变化的基因就可能是这个突变基因所调控的信号通路。加药呢?也是一样的,加药后,下游基因有了什么样的变化
,这些变化主要是在哪些信号通路上。有可能这个药物就是通过这些信号通路起到作用的。现在大概明白了吧?那应该怎么样来做这样的芯片数据分析呢
?给你看看夏老师几年前做的视频先!
这是一个简单的加姜黄素处理的芯片的分析。就下面,土豪随意……DAVID(https://david.ncifcrf.gov/)这个分析网站还挺好用的,大家可以随意试用一下感受感受。别再问我这个Excel怎么下载了
,自己去找我以前的帖子吧。祝你们心明眼亮。联系客服