福尔马林浸泡处理石蜡包被（FFPE）的人类组织样本目前是分子层面及临床研究的重要样本来源。FFPE样本含有大量宝贵的信息，可用于癌症表观遗传研究。尽管目前癌症表观遗传学方面的研究日趋增多，但FFPE样本的真正价值还没有全部体现出来。究其原因，主要是由于这些样本通常会产生高度降解的DNA，因而在甲基化、基因分型等基于芯片的应用中，通常表现不佳。中科普瑞利用Infinium HD FFPE DNA修复试剂盒等技术方案，修复这些降解的DNA样本，为您的FFPE样本后续实验保驾护航。
促销内容
Infinium HD FFPE DNA修复服务+ Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip（850K芯片）服务，赠送高级分析服务
原价：6000元 促销价：4500元
促销服务
1. Infinium HD FFPE DNA修复服务
修复过程在重亚硫酸盐处理后进行，FFPE修复技术能够修复片段化的DNA和损伤DNA模板，逆转FFPE样本的交联状态，避免扩增抑制的现象。修复后的样本更加接近样本的原始状态，实现更精准的DNA甲基化检测。
2.Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip（850K芯片）服务/含基础分析内容
850K芯片是新一代的DNA甲基化检测芯片。在数据上包含了原450K 芯片91%的位点，同时增加了413,745个新的位点，全面覆盖基因启动子区、编码区、CpG岛及ENCODE、FANTOM5发现的增强子区域。
850K 甲基化芯片是肿瘤和其他复杂疾病研究的有力工具，也是目前最适合表观全基因组关联分析（EWAS）研究的DNA甲基化研究技术。
基础分析内容：
beta密度曲线
展示样本beta值的整体状态，通常呈“双峰型”
差异甲基化位点热图
展示样本的组间和组内的差异甲基化位点
特定差异甲基化区域
展示差异甲基化区域的详细信息
拷贝数变异分析
基于各CpGs的信号值展示每个样本的拷贝数变异情况
3. 高级分析服务（赠送）
甲基化显著波动位点（DVP）分析是一种基于组间数据变异程度的分析方法，观测DNA甲基化beta值得“波动性”，其分析策略区别于差异甲基化位点（DMP）。对于肿瘤样本或复杂疾病，DVP分析往往能得到DMP分析中无法找到的CpGs。
如图对于某一DNA甲基化位点，在N组中绝大多数样本处于高甲基化水平，而在C组中一部分人群的beta值呈下降趋势，整体数据呈现“波动”状态。
甲基化显著波动位点（DVP）分析
促销说明
促销时间：2019年5月10日 - 7月31日
样本类型：FFPE样本
起订数量：12个样本起订
Infinium HD FFPE DNA修复处理结果展示
1. 下图展示修复后FFPE样本与新鲜冻存FF样本间的相关性，样本为9个儿童脑肿瘤FFPE和FF样本。两张图分别表示相关性系数最低和最高的样本，相关性均超过0.9。可以看到，FFPE修复技术对于样本本身状态的还原效果是显著的。
参考文献：Kling T , Wenger A , Beck S , et al. Validation of the MethylationEPIC BeadChip for fresh-frozen and formalin-fixed paraffin-embedded tumours[J]. Clinical Epigenetics, 2017, 9(1).
2. 下图展示FFPE样本修复前后的相关性，样本为结肠癌。可以看到未修复的FFPE样本与FF相关性系数波动极大，说明FFPE样本本身存在一定的不稳定性和不确定性。但在修复之后，整体FFPEr样本与FF相关性系数均超过0.9，表现出较修复前更高的样本质量。
参考文献：De Ruijter T C , De Hoon J P , Slaats J , et al. Formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue epigenomics using Infinium HumanMethylation450 BeadChip assays[J]. Laboratory Investigation, 2015, 95(7):833-842.
3. 下图通过三重real-time定量 PCR分析130个质量不一的FFPE样本和对照DNA(每个2ng)，分别测出这些经过修复样本的Ct 值，扣除对照DNA的平均Ct后得到DeltaCt，将其与在Infinium HD芯片上的可读率（call rate）做成散点图。从图中可以看出80% Delta Ct 值小于6的样本分型成功（橘黄色框里）。鉴于样本储存年限（1-35年）和来源的不同，QC的通过率位于35%-90%之间。总体来说，年限小于15年的样本基本都能被成功修复。
参考文献：Pokholok DK, Le JM, Steemers FJ, Ronaghi M, Gunderson K. Analysis of restored FFPE samples on high density SNP arrays. Presented at American Association of Cancer Research Meeting, May 2010.
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