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医药加生物信息学——高通量数据挖掘、TCGA&GEO数据库挖掘、中药网络药理

医药加金牌学习班,已经在全国举办了几百期。为广大医学科研工作者服务。学习班以教的多,学的会,用的上为宗旨。良好的上课氛围,完善的课后跟进,让学习班受到了学员好评。

有很多学员反馈,通过学习,掌握了技能,已经发表或者在投SCI

所有生物信息系列的学习班,都是理论讲解配合实际操作保证学得会

 北京班安排 

地点:北京市东城区永外彭庄甲58号 金泰绿洲酒店

时间:6月13-14 测序与芯片的高通量数据挖掘分析学习班   2800元

           6月15-16 中药网络药理学学习班                   3000元

 上海班安排 

地点:上海市浦东新区科苑路866号 中兴和泰酒店

6月29-30 TCGA&GEO数据库数据挖掘分析学习班      2800元

优惠政策:3人组团,每人优惠100元,4人组团,每人优惠200元。6人组团,可免其中一人费用。可跨班组团。

以下为学习班详细介绍

测序与芯片的高通量数据挖掘分析学习班( 北京)

课程背景:

很多老师都做过测序或者芯片实验,或者在公共数据库下载了高通量数据,虽然公司已给出了一部分的标准数据分析,比如过滤、质控、比对、定量和差异等,但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析,并不能完整的讲一个故事!因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力,从海量信息中获得自己想要的关键结论,比如关键基因、关键通路等!

讲师背景:

宋伟,交大生物信息学博士,参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。

主要内容:

1.各个学科与生信的密切关联(比如通过文献了解临床医学与生信的关联)及科研思路。

2.重要的数据库使用介绍(比如NCBI GEO数据库,含有超过280万的样本)

3.重要的生信在线工具实操(比如用来做差异分析的GEO2R、用来做功能富集分4.析的DAVID、用来做蛋白互作分析的STRING等)

5.重要的生信本地软件实操(比如用来做网络图构建与分析的cytoscape、用来做6.热图的HEMI等)

7.实战串联。基于一套数据,通过培训所讲的数据库、在线工具和本地软件进行生信分析,获得一个完整的逻辑的创新的分析结果报告。

学习目标:

通过2天的培训,使学员掌握生信文献分析思路和实用操作知识点(数据库、在线工具和本地软件),可以独立完成一篇基于公共数据库的高通量数据挖掘分析。

使用软件:Cytoscape,Heml

详细课程见课表

 感兴趣的小伙伴请戳图报名

中药网络药理学学习班(北京)

课程特色:

针对没有任何生物信息学基础和计算机编程基础的学生,讲授不用写程序的网络药理学分析方法。使学生掌握网络药理学的研究原理、研究方法和手段。

讲师为长期从事中药网络药理学的教授,结合个人实践经验,带领广大学员,从科研设计、项目具体实施以及SCI文章发表等多个方面,通过实际案例,介绍中药网络药理学的研究思路及具体方法。

讲师背景:

赵老师,多年从事生物信息学及中药网络药理学方面的研究, 发表生物信息学、网络药理学及中药复方相关SCI数十篇,含多篇5分以上的文章,主持多项国家自然基金和省部级科研课题,获得多项省部级科研及教学奖项。讲课效果好,获得学员好评。

主要内容:

1.介绍网络药理学的发展历史、核心问题、研究流程;

2.根据研究流程,介绍中药主要成分的获取和筛选;

3.中药和西药靶点的获取、疾病基因的获取;

4.中药所影响的生物学过程的识别;

5.网络构建、分析、可视化、美化等内容;

6.典型网络药理学研究文献的分析;

7.中药网络药理学课题涉及和基金申请。

学习目标:

通过本课程的学习, 学生可以独立对复方或单体开展网络药理学的研究. 如果学生的实验室已经作了基因芯片或蛋白组学实验, 可以用学到的网络药理学方法分析这些组学数据; 如果没有做这些实验,也可以用讲到的方法查询自己研究的复方的有效成分和靶点, 然后进行网络药理学分析.

适合人群:

各级医院临床医生、药师、科研单位研究人员、高校硕/博士研究生、对中药复方和网络药理学感兴趣的广大师生(尤其适合初学者和无基础的学员,无需任何编程基础)。

使用软件:Cytoscape

详细课程安排见课表: 

 感兴趣的小伙伴请戳图报名

TCGA&GEO数据挖掘分析学习班(上海)

课程特色:

很多老师都做过测序或者芯片实验,或者在公共数据库下载了高通量数据,虽然公司已给出了一部分的标准数据分析,比如过滤、质控、比对、定量和差异等,但是这些分析属于基础傻瓜式的标准分析,并不能完整的讲一个故事!因此,需要我们自己掌握高通量数据挖掘的能力,从海量信息中获得自己想要的关键结论,比如关键基因、关键通路等!

讲师背景:

宋伟,交大生物信息学博士,参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。

主要内容:

1.测序及芯片介绍。转录组学、基因组学、表观组学、顺反组学、宏基因组学;

2.经典生信SCI文章的解读及分析思路学习。

3.TCGA数据库的介绍和使用(含33000多个样本)。TCGA数据库癌症数据下载;TCGA数据书库癌症数据的处理;TCGA数据分析;

4.GEO数据库的高通量芯片数据查找、筛选、探针转换、差异分析等;

5.基于TCGA的lncRNA-miRNA-mRNA全转录组整合分析思路演练;基于TCGA的甲基化与转录组整合分析思路演练等

6.实战串联。基于一套癌症数据,通过培训所讲的数据库、在线工具和本地软件进行生信分析,获得一个完整的逻辑的创新的分析结果报告。

学习目标:

通过两整天培训,掌握TCGA,GEO数据库的使用、下载及分析思路和实用操作知识点(数据库、在线工具和本地软件)。可以独立完成一篇基于癌症公共数据库的高通量数据挖掘分析。

使用软件:Heml

详细课程安排见课表:

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