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NEB全球首推甲基化领域的颠覆性技术革新:一种高效替代重亚硫酸盐转化的酶学转化法!诚邀您参加甲基化测...

您还在使用重亚硫酸盐转化进行全基因组甲基化建库吗?

您还在为重亚硫酸盐转化繁琐的实验流程而烦恼吗?

您想一对一抢先了解 NEBNext 酶学转化法甲基化建库产品吗?

您想在 NEB 用户体验中心亲手完成一次酶学转化法甲基化建库流程吗?

即日起至 2019 年 6 月 30 日,扫描下方二维码填写个人信息可申请加入“NEB 甲基化测序建库体验星标计划”,请务必填写正确信息。我们在接到您的申请后会第一时间与您联系,为您介绍该颠覆性技术,您也有机会至 NEB 北京用户体验中心参与“NEB 甲基化主题日”体验完整建库流程。

信息审核将在申请日期截止后 1–2 月内完成,请您密切关注微信公众号通知,感谢您的理解与支持!

NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒,重新定义您的全基因组甲基化建库方式!

产品简介

虽然重亚硫酸盐测序是研究 DNA 甲基化的金标准,但这种转化方式会对 DNA 造成损伤,导致 DNA 断裂、丢失和 GC 偏嗜。NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒 (EM-seq) 提供了一种酶学方法代替全基因组重亚硫酸盐处理DNA(WGBS)的方法,并结合高效流程化的建库步骤,适用于 Illumina 平台测序。

高效的 EM-Seq 酶促转化可最大程度地减少对 DNA 的损伤,结合提供的 NEBNext Ultra II 文库制备流程,最终产生的高质量文库可以从有限的测序数据中更灵敏的检测到 5-mC 和 5-hmC。

EM-Seq 和重亚硫酸盐转化的方法原理

八大优势

  • 更卓越的 5-mC 和 5-hmC 检测灵敏度

  • 更高的比对率

  • 更均一的 GC 覆盖度

  • 能从有限的测序数据检测到更多的 CpG 位点

  • 更均一的二核苷酸分布

  • 更长的文库插入片段

  • 更高效的建库流程

  • 提供转化模块

EM-Seq 能得到更高的文库产量

采用 Covaris S2 仪器将 10 ng, 50 ng, 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。上述所有起始量,EM-Seq 都能使用更少的 PCR 循环得到更高的文库产量,表明 EM-Seq 显著减少了WGBS 方法中的 DNA 损失。误差条表示标准差。

NEBNext 酶学转化法甲基化文库

可获得更长的插入片段

采用 Covaris® S2 仪器将 50 ng 人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina MiSeq (2 X 76 bases) 测序,片段大小采用 Picard2.18.14 测定。图中绘制了每个插入片段出现的频率标准化后的数据,结果如图:EM-Seq 建库后的插入片段比 WGBS 方法得到的插入片段更长,说明:酶学转化法不会对 DNA 造成损伤,而重亚硫酸盐处理的 DNA 有严重损伤。

相较于 WGBS,EM-Seq 在更低的测序

覆盖深度情况下能检测到更多 CpG 

点,并能实现更卓越的 GC 均一覆盖度。

采用 Covaris S2 仪器将 10 ng, 50 ng, 200 ng 不同起始量的人 NA12878 基因组 DNA 打断至 300 bp,同时作为 EM-Seq 和 WGBS 建库的起始样本。对于 WGBS 方法,使用 NEBNext Ultra II DNA 进行建库,随后采用 Zymo Research EZ DNA Methylation-Gold 试剂盒进行重亚硫酸盐转化。两个文库均使用 Illumina NovaSeq® 6000 (2 X 100 bases) 测序,使用 bwa-meth 0.2.2 将测序数据与 hg38 进行比对。

A: CpG 位点检测:通过分析 3.24 亿双端数据得到 EM-Seq 和 WGBS 文库的 CpG 位点覆盖度,其中每条链都独立计数,最终得到最多 5600 万个可能的 CpG 位点。结果显示:EM-Seq 在更低测序深度能检测到更多的 CpG 位点。

B:相较于 WGBS,EM-Seq 在更低的测序覆盖深度情况下能检测到更多的 CpG 位点:图中显示了 EM-Seq 和 WGBS 两种方法在不同起始量,至少 1X 和 8X 覆盖度下检测到的独有和共有的 CpG 位点。EM-Seq 在至少 1X 覆盖度下比 WGBS 多检测到 20% 以上的 CpG 位点。而在至少 8X 覆盖度下,CpG 位点覆盖度差异增加至 2 倍。

C: GC 覆盖度:使用 Picard 2.17.2 计算 GC 覆盖度,图中显示不同 GC 含量时 (0-100%),标准化后覆盖度的分布情况。结果显示:EM-Seq 文库显著提高 GC 覆盖度的均一性,无 AT 过度测序,也无 GC 测序不足,后两项都是 WGBS 文库的典型缺陷。

订购信息

产品名称货号规格
NEBNext 酶学转化法甲基化建库试剂盒E7120S/L24/96 reactions
NEBNext 甲基化建库酶学转化法模块E7125S/L24/96 reactions
NEBNext 酶学转化法甲基化建库多样本接头引物(双端检索引物)E7140S/L24/96 reactions
NEBNext Q5U™ 预混液M0597S/L50/250 reactions

您可登陆 NEBNext.com 获取更多性能数据和信息。

如需产品订购可随时与您身边的 NEB 授权经销商取得联系,请“点击原文”获取各地经销商联系方式。

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