Cell Reports：胃癌前病变和早期胃癌的单细胞转录组网络

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Cell Reports：胃癌前病变和早期胃癌的单细胞转录组网络

炎癌转化是肿瘤高发的一个重要因素。如何深入理解非可控性炎症恶性转化的分子网络机制、寻找炎癌转化的标志物和干预靶点是炎癌转化早期逆转、精准防治的一个重点和难点问题。与此同时，中医经常采用寒、热等理论对炎症和肿瘤患者进行辨证论治，如何理解中西医的关系，助力炎癌转化早诊早治、个体化诊疗也是一个值得探索的关键问题。

清华大学自动化系、信息国家研究中心李梢课题组以胃炎癌转化为范例，在解析胃炎癌转化单细胞网络、发现胃癌极早期细胞标志物，由此促进胃癌中西医精准防控方面取得重大进展。

研究成果以“Dissecting the Single-Cell Transcriptome Network Underlying Gastric Premalignant Lesions and Early Gastric Cancer”（解析胃癌前病变和早期胃癌的单细胞转录组网络）为题，于2019年5月7日在线发表于Cell子刊Cell Reports（《细胞报告》）上。李梢教授为该文通讯作者，清华大学博士生张鹏为第一作者，中日友好医院医生杜时雨在样本采集上提供了重要帮助。

原文检索：

Dissecting the Single-Cell Transcriptome Network Underlying Gastric Premalignant Lesions and Early Gastric Cancer

Nature打开神秘通路：利用mRNA结合蛋白对抗癌症

生物通报道：早在50年前，科学家们就开始了针对真核起始因子3（eIF3）的研究，研究人员发现当eIF3结合一组特异的mRNAs，其选择性控制mRNA翻译的能力才会被开启。eIF3与这些mRNAs结合打开了eIF3中的一个口袋，随后附着在mRNA的端帽上，触发了翻译过程。

近期来自加州大学伯克利分校的研究人员发现这一通路中的新机制，指出一种有前景的新药物靶标可以控制了机体一小部分蛋白质的生成，而这些蛋白对于调控生长和细胞增殖至关重要。

如果癌细胞正在生成过多的mRNA，你可以通过阻止癌细胞利用这一mRNA来生成蛋白质由此让它们停工。由于常规的翻译不会利用这一结合蛋白——并不是每个mRNA都利用该蛋白，你或许能够通过靶向它来获得更特异的抗癌效应。“对于我来说，就像发现了打开旧书桌中隐藏抽屉的一个秘密杠杆。这一书桌存在了大约15亿年，数十年来许多人一直在研究它，而我们发现了如何触动这一通路”，文章作者加州大学伯克利分校分子与细胞生物学、化学教授Jamie Cate说。

原文检索：

eIF3d is an mRNA cap-binding protein that is required for specialized translation initiation

Nature 又一意外新发现：明星抑癌基因 BRCA1 的作用新方式

由伯明翰大学领导的一项最新研究发现了 BRCA1 基因发挥作用的重要新方式，这有助于我们了解卵巢癌和乳腺癌的发展机制。

这一研究成果公布在 7 月 3 日的 Nature 杂志上，由伯明翰大学癌症与基因组科学研究所的研究人员领导完成，是一项为期五年研究项目（识别和理解乳腺癌基因）的一部分。

文章一作，伯明翰大学 Manolo Daza-Martin 解释说：「没有两个人生来就是一样的，因此，在我们有生之年，我们都有不同的发病风险，这是我们基因自然变异的结果。」

原文检索：

Daza-Martin et al (2019). 'Isomerization of BRCA1-BARD1 promotes replication fork protection'. Nature. DOI: 10.1038/s41586-019-1363-4

为液体活检敲警钟？正常女性也存在TP53突变

随着液体活检的流行，研究人员正在探索是否能够利用从肿瘤上脱落的细胞或DNA来进行癌症检测。不过，华盛顿大学的研究人员在开展此类研究时，却发现未患癌症的女性也存在低频率的TP53突变。

研究人员在《Cell Reports》杂志上报道称，这些突变随着年龄的增长而积累，并且与癌症个体中发现的TP53突变相似。这种低频率的TP53突变存在于多个健康的组织中，下至新生儿，上至百岁老人。他们认为这一结果可能对基于液体活检的癌症筛查检测产生影响。

华盛顿大学的Rosa Ana Risques及其同事认为，如今往往以突变作为癌症标志物，但这项研究具有警示意义。“与此同时，随着我们证明高度灵敏的新一代测序方法对于突变检测至关重要，我们也认识到与生物学相关的特异性挑战。”

原文检索：

Ultra-Sensitive TP53 Sequencing for Cancer Detection Reveals Progressive Clonal Selection in Normal Tissue over a Century of Human Lifespan

Cell子刊从不同的角度看CRISPR-Cas9：让“剪刀”卡住

在生物技术领域，CRISPR-Cas9 已经成为了一个热门话题，因为它可以作为一种精确的基因编辑工具，帮助科学家们了解和改变基因。但在人类利用它之前，CRISPR-Cas9 其实就是一种细菌内部免疫系统，用于切割噬菌体的 DNA，抵御噬菌体或感染细菌的病毒。

近期，来自美国埃默里大学医学院，Max Planck 的研究人员发现 CRISPR-Cas9 这把「分子剪刀」有时会卡住。

Cas9 是一种切割 DNA 的酶，它也可以在不进行任何切割的情况下阻断基因活性。在致病细菌 Francisella novicida 中，Cas9 能调控致病菌需要关闭的基因。

这一研究发现公布在 6 月 27 日的 Molecular Cell 杂志上。

原文检索：

Catalytically Active Cas9 Mediates Transcriptional Interference to Facilitate Bacterial Virulence