Linux学习-常见错误和快捷操作

作者：陈同

来源：生信宝典

Linux下命令的一些异常情况

命令不全：在命令没有输入完 (引号或括号没有配对)，就不小心按下了Enter键，终端会提示出一个>代表命令不完整，这是可以继续输入，也可以ctrl+c终止输入，重新再来。(下面sed命令使用时，还有另外一种命令不全的问题)

ct@ehbio:~/ehbio_project$ rename \\\\'ehbio2
>\\\\'
ct@ehbio:~/ehbio_project$ rename \\\\'ehbio2
> ^C
ct@ehbio:~/ehbio_project$

         （↑可按住屏幕左右滑动）

文件名输入错误: 多一个字母、少一个字母、大小写问题

ct@ehbio:~/ehbio_project$ls
ehbio2.fa  ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio.fa  second.fa

# 重命名没有生效
ct@ehbio:~/ehbio_project$ rename \\\\'ehbio2\\\\' \\\\'ehbio5\\\\' ebio2.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
ehbio2.fa  ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio.fa  second.fa

# 仔细看是ehbio2.fa写成了ebio2.fa，更正后即可。
Z8vb3e9jtel4m99ss6e7eZ:~/ehbio_project$ rename \\\\'ehbio2\\\\' \\\\'ehbio5\\\\' ehbio2.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio.fa  second.fa

         （↑可按住屏幕左右滑动）

Linux终端常用快捷操作

· 命令或文件名自动补全：在输入命令或文件名的前几个字母后，按Tab键，系统会自动补全或提示补全

· 上下箭头：使用上下箭头可以回溯之前的命令，增加命令的重用，减少输入工作量

· !加之前输入过的命令的前几个字母，快速获取前面的命令

ct@ehbio:~/ehbio_project$ cut -f 1 -d \\\\' \\\\' ehbio.fa | tail -n 4
>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA
end
ct@ehbio:~/ehbio_project$ man cut
# 直接跳到上面运行的cut命令，再执行一次
ct@ehbio:~/ehbio_project$ !cut
cut -f 1 -d \\\\' \\\\' ehbio.fa | tail -n 4
>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA
end

         （↑可按住屏幕左右滑动）

· ctrl+a回到命令的行首，用于修改常命令或注释掉命令

# 写完下面的命令，突然不想运行了，又不想一个个删掉
ct@ehbio:~/ehbio_project$ cut -f 1 -d \\\\' \\\\' ehbio.fa | tail -n 4

# 按ctrl+a, 回到行首，再输入`#`号，回车，命令即被注释掉。
ct@ehbio:~/ehbio_project$ #cut -f 1 -d \\\\' \\\\' ehbio.fa | tail -n 4

         （↑可按住屏幕左右滑动）

· !! 表示上一条命令。

ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls
ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio6.fa  ehbio.fa  second.fa
ct@ehbio:~/ehbio_project$ !!
ls
ehbio3.fa  ehbio4.fa  ehbio5.fa  ehbio6.fa  ehbio.fa  second.fa

         （↑可按住屏幕左右滑动）

· 替换上一个命令中的字符，再运行一遍命令，用于需要对多个文件执行同样的命令，又不想写循环的情况

# 输入一个命令
ct@ehbio:~/ehbio_project$ #cut -f 1 -d \\\\' \\\\' ehbio.fa | tail -n 4

# !!表示上一条命令
# :gs表示替换，把上一个命令中全部的ehbio替换为ehbio3; g: global; s: substitute
ct@ehbio:~/ehbio_project$ !!:gs/ehbio/ehbio3
#cut -f 1 -d \\\\' \\\\' ehbio3.fa | tail -n 4

# 替换后效果如上

# 去掉命令前的#号
ct@ehbio:~/ehbio_project$ cut -f 1 -d \\\\' \\\\' ehbio3.fa | tail -n 4
>mYC
ACGGAGCGAGCTAGTGCAGCGAGGAGCTGAGTCGAGC
CAGGACAGGAGCTA
end