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解锁新技能,手把手教你掌握ceRNA 网络构建!

ceRNA网络构建

医学方前期出品的3个数据挖掘的课程广受学员的好评,其中《GEO、TCGA、Oncomine数据库》课程着重介绍了几个数据库的基本用法,包括从数据的下载、数据的预处理、差异基因的筛选、功能富集等等,最快速地带领大家走入生物信息学的大门,从一开始建立对分析数据的自信心。

《豪斯医生数据挖掘之WGCNA详解》课程是基于前一个课程的基础再度进行拓展,通过一系列算法的运算,构建符合生物学的基因无尺度网络,进而通过与外部临床信息的关联,筛选特定的感兴趣的模块,最终获得若干个核心基因,对自己即将开展的预实验具有非常重要的提示作用。
《miRNA调节网络的构建》则将重心从编码RNA转向了非编码RNA,利用WGCNA的算法和数据库的多重比对,构建了miRNA的调节网络,揭示miRNA与mRNA之间的生物学联系。

针对目前科研热点,医学方继续推出数据挖掘课程《基于TCGA数据库ceRNA网络构建》,ceRNA又称竞争性内源RNA,其较好的整合了多分子之间的相互关系,不仅是目前科学研究的一大热点,同时又是文章发表的一大亮点,而且其背后所蕴含的各类数据清洗和处理的方法也是学习其它组学的奠基石。研究ceRN有重要的生物学意义,例如癌症等疾病的分子机理的解析,对后期的疾病诊治,药物开发等意义重大。
此次,医学方邀请了Flyman老师,手把手教大家如何基于TCGA数据库构建ceRNA网络。此次课程分为十部分内容,共23节课,学好该课程,既可以给大家提供一个发paper的思路,还可以提升大家的数据清洗的能力
课程原价仅为388元,新课首发,100元优惠券限量发行中,机不可失,先领先得!
购买方式
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打开网页,输入课程链接:

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学习目标
了解ceRNA的基本概念
学会TCGA中mRNA/lncRNA/miRNA表达矩阵的下载
学会miRNA成熟体与前体表达矩阵的下载 

学会用DEseq2进行差异分析

掌握miRNA靶基因的获取
学会批量miRNA靶基因的获取
掌握lncRNA靶基因的获取
构建lncRNA-miRNA-mRNA网络
学会Cytoscape可视化ceRNA网络
Cytoscape网络的美化
适合人群
适合于所有医药类研究人员以及对ceRNA感兴趣的科研人员。如果您对ceRNA有知识背景或者有一定R语言的编程基础,学起来将更加省力。
课程特色

ceRNA又称竞争性内源RNA,其较好的整合了多分子之间的相互关系,是目前科学研究的一大热点,同时又是文章发表的一大亮点,而且其背后所蕴含的各类数据清洗和处理的方法也是学习其它组学的奠基石。不可否认,如果可以深度挖掘ceRNA,轻则可以发paper,重则可以申基金。因此本教程的推出,既可以给大家提供一个发paper的思路,还可以提升大家的数据清洗说的能力,本课程具有以下亮点:

  一键解锁TCGA的多种数据的多种下载方式,可以轻松入门TCGA。

  miRNA成熟体和前体的区别以及两种表达矩阵的下载。

  多种方法批量解锁miRNA靶基因的获取,不在为几十个miRNA的靶基因获取而烦恼。

  学会从TCGA中获取lncRNA的表达矩阵

  解锁lncRNA靶基因的获取

  Cytoscape网络构建与美化

在本次视频中,希望大家都能学会基于TCGA数据库ceRNA网络构建。

课程安排

① ceRNA背景知识 

② TCGA数据下载

③ lncRNA表达矩阵获取

④ miRNA数据下载

⑤ mRNA/lncRNA/miRNA差异分析

⑥ 基于数据库miRNA靶基因获取

⑦ 批量预测miRNA靶基因

⑧ lncRNA靶基因获取

⑨ 基于Cytoscape构建ceRNA调控网络

⑩ Cytoscape网络的美化

讲师介绍

Flyman
毕业于第二军医大学,长期从事生物信息学研究。擅长领域:R语言编程,绘图,perlpython的文本处理,linux的命令与测序文件的解读,对GEOTCGASEER数据库等常用数据库进行数据整理挖掘等,受到学员们广泛好评。

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