携带有MYCN扩增的脊柱室管膜瘤预后不良,应定义为新的脊柱室管膜瘤分子亚型:SP-ENP-MYCN。
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研究背景
室管膜瘤是发生在成年和儿童中具有异质性的原发性中枢神经系统肿瘤。基于DNA甲基化分析,室管膜瘤被分为9个不同的分子亚组,分别是定位在幕上、后颅窝和脊柱中各3个亚型。脊柱室管膜瘤的三个分子亚型是脊柱室管膜下瘤(SP-SE), 脊柱毛细胞血管室管膜瘤(SP-MPE)和脊柱室管膜瘤(SP-EPN)。脊柱室管膜肿瘤通常生长缓慢并且划分良好。临床结果通常优于颅内室管膜瘤,5年OS为60%至90%。某些脊柱室管膜预后不良,如倾向于浸润脊髓并表现出侵略性生物学行为的WHO III级室管膜瘤。脊柱室管膜肿瘤已明确是具有不同的体细胞拷贝数变异(CNV),但目前尚未发现其复发性和侵袭性的驱动分子。近期在Acta Neuropathologica期刊上发表了一项最新研究结果,该研究使用全基因组DNA甲基化分析,发现和定义了一种新的脊柱室管膜瘤肿瘤分子亚型(SP-ENP-MYCN)。
图1:t-SNE分析显示SP-EPN-MYCN-队列(n = 13)与所有九个主要分子亚组的500个室管膜瘤的DNA甲基化聚类。与其他分子室管膜亚组相比,SP-EPN-MYCN(紫色)显示出不同的甲基化模式。
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研究方法
该研究首先从大量中枢神经系统肿瘤的DNA甲基化组和拷贝数变异谱中分析并发现一类新的脊柱室管膜瘤亚型(SP-EPN-MYCN)(图1);然后从国际联合中心收集具有该类甲基化特征的13例样本,并通过拷贝数变异分析和FISH验证13例肿瘤样本中都具有MYCN扩增;接着对13例样本进行病理分析、组织分型和免疫组化实验;最后对新定义的脊柱室管膜瘤亚型患者的OS和PFS和预后情况进行统计分析。
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研究结果
该研究发现一个新的、相对罕见的脊柱室管膜瘤亚组,DNA甲基化分析鉴定该亚型是不同于目前已知的室管膜瘤分子亚组。DNA甲基化阵列的拷贝数变异和FISH验证结果显示MYCN扩增是该群组所有病例的特征性遗传改变(n = 13)。群组中10例病理诊断为间变性室管膜瘤(WHO III),3例病理诊断为典型室管膜瘤(WHO II)。5例原发性肿瘤和7例复发的组织学重新评估显示出假玫瑰花结、GFAP-和EMA阳性的组织学特征,显微镜显示肿瘤样品中具有纤毛、复杂的细胞间连接和中间丝(图2)。基于上述结果,作者定义了携带有MYCN扩增的脊柱室管膜瘤新亚型(SP-ENP-MYCN)。
SP-EPN-MYCN肿瘤显示出在硬膜内,髓外定位主要在胸椎和颈椎内,弥漫性软脑膜扩散遍及整个CNS和浸润性侵入脊髓的生长模式。SP-EPN-MYCN即使接受非常积极的治疗仍显示出比先前描述的典型脊柱室管膜瘤亚组具有更差的中位无进展存活(PFS)(17个月)和中位总生存期(OS)(87个月)。OS和PFS与伴有RELA融合的幕上室管膜瘤(ST-EPN-RELA)和后颅窝室管膜瘤A型(PF-EPN-A)相似,表明其具有高的侵袭性。
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研究结论
本研究定义了SP-EPN-MYCN为室管膜瘤的一个新分子亚型,并倡导MYCN扩增应用于诊断SP-EPN-MYCN室管膜瘤的分子标志物。
图2:SP-EPN-MYCN高细胞神经外胚层肿瘤的组织学特征。a. 血管周围假念珠菌, b. 微血管增生, c. 血管周围增强的GFAP表达, d.点状EMA阳性,e. 活跃的有丝分裂活动, f.肿瘤坏死,g. 高Ki-67标记,h. 广泛的核MYCN表达。
图3:SP-EPN-MYCN(n = 12)的PFS和OS Kaplan-Meier曲线分析。
文章来源:Acta Neuropathol. 2019 Aug 14. doi: 10.1007/s00401-019-02056-2. [Epub ahead of print]
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