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胶质瘤PPM1DΔC突变的生物学机理

研究背景

01

蛋白磷酸酶Mg2 + / Mn2 +依赖性1D(PPM1D)基因,也称为Wip1,编码丝氨酸/苏氨酸磷酸酶,使多种蛋白质去磷酸化,这些蛋白质主要参与DNA损伤反应(DDR)和细胞检查点途径。PPM1D已成为一种常见的致癌基因,在多种癌症中被发现扩增或过表达,包括乳腺癌,卵巢癌,胃肠道癌和脑癌。PPM1D的C端的截短突变在小儿神经胶质瘤中,包括弥漫性脑桥脑胶质瘤(DIPG)被鉴定。由于没有PPM1D截短突变(PPM1DΔC)的胶质细胞系,限制该突变在胶质瘤形成中的作用阐述。近期在Nature communication杂志中报道胶质瘤PPM1DΔC突变的促癌生物学机理。

PPM1D突变调控NAPRT机制

研究方法

02

该研究首先通过CRISPR/Cas9基因编辑技术构建PPM1DΔC突变细胞系,并使用一组针对DNA修复和代谢蛋白的抑制剂进行小分子合成致死筛选。接着作者通过测定NAD代谢组来明确PPM1DΔC突变通过改变NAD代谢通路来介导代谢抑制剂合成致死。最后通过一系列的体外和体内实验证明PPM1DΔC突变与DNA代谢通路关键性酶NAMPT的调节关系。

常见PPM1DΔ突变形式

研究结果

03

本研究构建PPM1DΔC突变的星形胶质细胞系,用于研究该突变在胶质瘤生成中的作用。通过靶向合成致死药筛选,研究证明PPM1DΔC突变星形胶质细胞和患者衍生的PPM1D突变DIPG系对烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)抑制剂的治疗特别敏感PPM1DΔC突变诱导对NAMPT抑制剂敏感性是由整个基因组中CpG岛的高甲基化驱动的,特别是由参与烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)生物合成的关键性基因烟酸磷酸核糖基转移酶(NAPRT)的表观遗传沉默来介导的。

NAD代谢途径

研究结论

04

本研究发现截断的PPM1D突变在胶质瘤中生物效应的重要见解。确定了致癌驱动突变和NAD代谢之间的关键性联系,可用于肿瘤特异性细胞杀伤。PPM1D激活突变有望成为肿瘤靶向治疗的新靶点。

文章来源:Nat Commun. 2019 Aug 22;10(1):3790. doi: 10.1038/s41467-019-11732-6.

阔然生物医药科技(上海)有限公司成立于 2015 年,总部位于上海,公司以基因组学、表型组学及生物信息学为技术核心,搭建了基础研究与转化、基因测序和质谱技术三大平台,专注于精准医学研究与成果临床转化。

阔然分别在上海、徐州、南通下设三个医学检验实验室,开设临床细胞分子遗传学检验、临床免疫学、临床体液专业项目,除了常规分子生物实验仪器外,还配备了 Illumina HiSeq2500测序仪、NextSeq 550测序仪、QuantaLlife微滴数字PCR系统、Cellsearch CTC检测系统,能够满足临床不同检测需求。 

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